N1cez-优快云博客

原创 git commit / push 报错文件不存在

尝试使用 git restore --staged filename 取消暂存，但是报错。

2024-10-20 15:18:08 402 1

适用于push到github中不存在的仓库；如果想修改已有仓库中的文件，需先clone下来打开。其中密码为github中申请的token，而不是登录密码；将刚才 ~/.ssh 中生成的 id_rsa.pub 文件中内容作为key复制到github中。由于个人用户没有root权限，因此在conda环境中下载git。在命令行使用git clone等操作时让输入名字和密码。push成功后，在github网站上可以看到这个仓库。2）commit 输入本次提交信息，提交到本地仓库。3）push 上传到远程仓库。

2024-10-14 16:44:35 971

原创 pip install ERROR: Could not install packages due to an OSError

WARNING: Retrying (Retry(total=4, connect=None, read=None, redirect=None, status=None))ERROR: Could not install packages due to an OSError

2024-10-11 16:29:39 252

原创 python 异常处理

【代码】python 异常处理。

2024-10-10 16:36:56 145

原创 huggingface 数据/模型下载

huggingface_hub Python包附带了一个名为huggingface CLI的内置CLI。此工具允许您直接从终端与Hugging Face Hub进行交互。例如，您可以登录您的帐户、创建存储库、上传和下载文件等。官方网站。

2024-10-04 14:31:52 671

原创 vscode 连接服务器不用输密码免密登录

在文件夹 C:\Users\xxxx.ssh 中可以查看新生成的密钥文件 id_rsa 和 id_rsa.pub。将 id_rsa.pub 中的内容粘贴进来。

2024-10-01 11:07:25 503

原创 linux conda 安装配置

这样，再次进入linux直接进入base环境。想要直接使用conda需要配置环境。3）重新加载 .bashrc 文件。按照提示回车/输入yes…

2024-09-29 19:05:35 477

原创 transformer 报错 AttributeError: module ‘torch.utils._pytree‘ has no attribute ‘register_pytree_node‘

44和40版本都报错。

2024-09-20 10:35:13 1734 2

原创 Endnote 插入参考文献毕业论文

点击快捷方式–>右键打开文件位置–>把GBT7714的style文件拷贝到Styles文件夹。点击Select another style。选择Chinese Std GBT7714…

2024-09-11 12:03:16 2052

原创 IEEE PDF eXpress 报错解决 Error in converting file + font not embedded

错误：Font TimesNewRomanPS-BoldItalicMT is not embedded (3x on page 3)点击图中按钮，跳转到Manual Conversion Request页面，提交即可，之后会收到一封邮件，包含转换后的合个文件。在上传文件后Fail，显示如下，或一直Validating转圈。：即使上传latex源文件也只会返回转换后合格的pdf文件。作者的错误发生在文中的pdf图片上，字体未嵌入。

2024-09-01 14:34:05 1922 1

原创 vscode 文件颜色变绿色

在设置中搜索Git:Enabled，取消Decorations: Enabled的勾选。解决：关闭git功能。

2024-07-21 22:48:41 722

原创 pytorch GPU cuda 使用报错整理

pytorch GPU 使用报错

2024-07-13 16:07:22 722

原创 ZDOCK linux 下载（无需安装）、配置、使用

LD_LIBRARY_PATH 环境变量未配置，请查找相关博客，stackoverflow中有解决办法（本人使用方法1解决无效）提供了解决办法，但是本人无法从博客中提到的下载链接中下载相应的文件，因此重新整理以下解决方法。查找 libmpi.so.0，发现没有这个文件，但是能够找到 libmpi.so。2）结果：生成2000个结果pdb，complex1.1.pdb是得分最高的。修改 libmpi.so 文件为 libmpi.so.0。2）mpiexec命令会报错，需要安装的包：OpenMPI。

2024-04-25 22:07:58 2021 2

原创 torchdrug 报错 RuntimeError: Ninja is required to load C++ extensions

【代码】torchdrug 报错 RuntimeError: Ninja is required to load C++ extensions。

2024-04-19 13:43:04 469

原创 vscode 连接远程服务器服务器无法上网离线配置 .vscode-server

使用vscode连接远程服务器时会自动下载配置.vscode-server文件夹，如果远程服务器无法联网，则需要手动下载2）vscode commit id获取点击导航栏中的Help–>About–>获取commit–>复制到上方网址即可下载文件。

2024-04-05 19:56:14 2657 5

原创 vscode 括号 python函数括号补全

解决方法在setting.json中添加 “python.analysis.completeFunctionParens”: true打开设置；点击图中按钮打开setting.json文件添加 “python.analysis.completeFunctionParens”: true

2024-02-04 11:51:40 1541

原创将word公式转成mathtype公式

通过WINWORD.EXE文件打开word，打开最近文件/打开文件找到想转换公式的word文档，再进行操作。1）网上的修改word的起始位置的方法/拷贝omml2mml.xsl文件的方法都不好用。1）选中一个word公式/直接全文word公式转换。2）点击Mathtype转换公式。

2024-01-27 12:18:05 8422 5

原创大模型微调报错：RuntimeError: expected scalar type Half but found Float

博主显卡：3090最初的设置：bfloat16开始训练后，线性层报错。

2024-01-25 13:42:07 2164

原创 python报错 ModuleNotFoundError: No module named xx

当你尝试导入一个模块时，Python 解释器会按照一定的顺序搜索模块的位置。PYTHONPATH 变量包含一个或多个目录的路径，这些路径是解释器用于查找模块的位置。如果你在执行 Python 脚本时遇到模块导入错误，可能是因为模块所在的路径没有包含在 PYTHONPATH 中。通过设置正确的 PYTHONPATH，你可以确保 Python 解释器能够找到你需要的模块。在路径中新建__init__.py文件，将代码转成一个可引用的模块，该文件可以为空。

2024-01-22 18:24:35 671

原创 notepad++去除重复行 python去除重复数据

subset: 指定要考虑的列（或列的组合），即基于哪些列判断是否为重复行。默认为所有列。keep: 控制保留哪个重复行。可选值有：‘first’（默认值）: 保留第一次出现的重复行。‘last’: 保留最后一次出现的重复行。False: 删除所有重复行。: 重置索引，以便新的DataFrame具有默认的整数索引。inplace: 是否在原地修改DataFrame，而不是返回一个新的DataFrame。

2024-01-14 14:20:21 1860

原创 git clone 代码克隆；hugging face 数据、模型下载

由于本人使用的是实验室的linux服务器，下载代码的时候会有网络问题，所以本文是基于ssh的方法。

2023-12-28 20:29:52 4784

原创 transformers 使用小记 transformers报错

解决：使用transformers版本为0.4.26，不够新，安装最新版transformers，例如4.36。

2023-12-27 19:04:59 1033

原创 Alphafold2 安装 linux 本地配置 conda配置非docker

作者配置：cuda113和cudnn804，安装的是：jaxlib-0.3.25+cuda11.cudnn805-cp38-cp38-manylinux2014_x86_64.whl。方法1：打开图2中的各个sh文件可以看到下载网址，复制网址到本地，下载后再传回linux服务器。：pdb_mmcif文件可以直接使用图2中的sh文件下载，它可以断点续传，但是需要wget, rsync, gunzip and tar等工具。图为官网给出的下载后的数据，我们一共需要下载9个文件（解压前）。

2023-12-26 21:07:25 4388 6