qq_20563997的博客

想保留一个文件夹里的几个文件，其他的好多文件想都删除了，于是就在网上找了找方法，发现有一个最靠谱而简单，分享给大家一下。如abc文件夹下有a、b、c三个文件，如何一行命令删除b和c,不删除a。有位童鞋在工作经常有此需求，本文将介绍其他童鞋提供的实现方法。

目前这两个脚本已经没人用了，留个纪念。

PBS是功能最为齐全，历史最悠久，支持最广泛的本地集群调度器之一。PBS的目前包括openPBS，PBS Pro和Torque三个主要分支。其中OpenPBS是最早的PBS系统，目前已经没有太多后续开发，PBS pro是PBS的商业版本，功能最为丰富。Torque是Clustering公司接过了OpenPBS，并给与后续支持的一个开源版本。下面是安装torque的过程。

主要分成三步：一、结构优化；二、静态自洽计算；三、非自洽计算以Al－FCC为例子。

VASP程序用多了，经常目录下会留下不少的WAVECAR,CHGCAR等文件。如果不用的话，占用很大的磁盘空间。下面这个Linux命令会删除你所在目录下所有的WAVECAR文件，请慎用！这样VASP就不会输出WAVECAR和CHGCAR文件。

VTST(Transition State Tools for VASP)是VASP的过渡态工具，可以免费获取：http://theory.cm.utexas.edu/vtsttools/index.html。里面还有VTST Scripts: vtstscripts.tgz，安装时不需要，使用时需要。VASP及VTST安装无需root权限，普通用户即可安装。

首先要计算一个氢气分子的孤立能量，再减去两个孤立氢原子能量，将得到氢气分子的结合能。

如果你有一个晶胞（或超胞），写成POSCAR，然后用v2xsf (http://nano.tu-dresden.de/~jkunstmann/software.html)这个程序（放入linux搜索路径下就成为命令）把他转化成*.xsf文件，然后就可以直接用xcrysden --xsf *.xsf来打开这个结构了。（3）（0.5,0.5,0.5），自然就是（1/2，1/2，1/2），而不是（1，1，1）在简单立方中表示顶点R，这是以基矢长度为单位的。没有固定的顺序，但是都是对的。

【代码】将ELFCAR、CHGCAR转化成MS阅读可读的fortran代码。

当ISMEAR等于其他的值时，Free energy TOTEN是与energy without entropy是不相等，则用。对呈现金属性的体系，费米能级就是该体系的真实（具有物理意义的）费米能级。在计算体系的结合能时，体系的总能取为energy without entropy后面的值。第一行给出体系的体积分别以Å3/atom, a.u.3/atom为单位给出的。上一行中第一个数就是体系的费米能级，第二个数就是体系的总价电子数。第二行给出体系的体积是以Å3/unit cell为单位给出的。

Dear all,Thank you.

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VASP计算不同磁状态的方法：顺磁采用ISPIN=1进行非自旋极化计算；铁磁用ISPIN=2并统一设置磁性原子MAGMOM；反铁磁需扩大晶胞并设置相反MAGMOM值，通过能量比较确定基态；亚铁磁类似反铁磁但磁矩绝对值不等。非共线磁矩需要指定x,y,z分量。例如Mn-Cu(001)反铁磁计算时，设置两个Mn原子大小相等、符号相反的MAGMOM即可。

摘要：本文通过VASP软件计算氢原子能量，比较了不同计算方法的结果。采用LSDA近似时，氢原子能量为-12.92eV；引入自旋限制(ISPIN=2)后，能量提高约0.88eV；改用GGA赝势后，计算结果更接近理论值-13.6eV，达到-13.67eV。文章还讨论了计算参数的设置，包括单K点采样、INCAR文件配置等，并指出由于使用赝势，对所得能级的解释存在困难，欢迎讨论。

近期帮朋友做个测试，用他给我的INCAR，提交到GPU节点会有如下报错，提交到CPU节点没啥问题。有可能是他在Windows环境里编辑过INCAR文档，直接传到服务器上的缘故。用vi看下INCAR文件，都是一些常规的选项，没有什么特别的。但是OUTCAR里发现有好多的^M字符。使用命令：dos2unix INCAR。的确有不少^M，NEDOS后面就有。Linux下去掉^M的四种方法。再提交就没啥问题了。

关于VASP计算不收敛的解决方法，有些帖子已经总结的很好了，可以根据自己遇到的情况直接拿来用。如果把这些方法都用了还是不行，恐怕是你的结构本身问题较大了。1. 帖子1：解决VASP计算SCF/几何优化/过渡态不收敛的方法总结2. 帖子2：关于VASP计算不收敛的一些实例与解决办法3. 官方：Difficult to converge systems。

氢气分子的解离能，也就是结合能,根据资料中给出的是约4.48eV。(G. Kresse & J. Hafner, Surface Sci. 459 (2000) 287)为此，首先要计算一个氢气分子的孤立能量，再减去两个孤立氢原子能量，将得到氢气分子的结合能。先计算单个原子能量，选取PAW_PBE文件夹下的H下面的POTCAR用到的其他输入文件如下：INCAR: SYSTEM ...

Dielectric properties of SiCTaskStatic dielectric propertiesDensity functional perturbation theoryTaskCalculation of the static and frequency dependent dielectric properties of SiC.Static dielectri...