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RSS订阅原创 去除INCAR中的^M字符
近期帮朋友做个测试，用他给我的INCAR，提交到GPU节点会有如下报错，提交到CPU节点没啥问题。有可能是他在Windows环境里编辑过INCAR文档，直接传到服务器上的缘故。用vi看下INCAR文件，都是一些常规的选项，没有什么特别的。但是OUTCAR里发现有好多的^M字符。使用命令：dos2unix INCAR。的确有不少^M，NEDOS后面就有。Linux下去掉^M的四种方法。再提交就没啥问题了。
2025-04-01 10:57:11
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原创 毕业论文+公式提取+文本提取+参考文献技巧
1. 公式提取比如我要提取一维薛定谔方程的公式：只需要把公式的图片copy，粘贴到网站，右侧即可出现公式的latex版和word版，根据需要复制即可。如果还需要编辑，可以使用在线的latex公式编辑器（修改完成也可以导出到需要的文档中。2. 文本提取比如我想提取下图中的文字。用微信截图功能。点击文本提取，即可从图片中将文本提取出来。3. 参考文献。
2025-04-01 10:42:54
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原创 Virtualbox安装Ubuntu18.04笔记
先sudo apt-get install build-essential，把gcc安装了。，最重要的一步是在以root用户编译那个文件。
2025-04-01 10:23:39
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原创 VASP计算不收敛的解决方法
关于VASP计算不收敛的解决方法，有些帖子已经总结的很好了，可以根据自己遇到的情况直接拿来用。如果把这些方法都用了还是不行，恐怕是你的结构本身问题较大了。1. 帖子1：解决VASP计算SCF/几何优化/过渡态不收敛的方法总结2. 帖子2：关于VASP计算不收敛的一些实例与解决办法3. 官方：Difficult to converge systems。
2025-04-01 09:11:58
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原创 VASP计算过渡态(CI-NEB)初始结构生成脚本汇总
使用VASP计算过渡态，最重要的步骤就是在得到了初态和末态结构之后，进行反应路径的插值，插值的优劣直接关系到后面的过渡态搜索的难易。
2025-03-29 18:24:02
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原创 VASP计算中ISMEAR取值的官方注意事项
VASP进行计算时，ISMEAR选项是一个比较重要的参数，关系到能量的计算准确性，缺省值为1，并不能适合所有的情况。
2025-03-29 18:11:10
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原创 推荐Sumatra PDF+欧陆词典组合阅读PDF文件
Sumatra PDF适应一些快捷键以后，还是挺好用的。还可以根据自己的需要，进行一些定制。体机小+速度快+无广告+免费。
2025-03-29 18:03:00
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原创 PDFgui安装问题
PDFgui is a convenient and easy to use graphical front end for the PDFfit2 refinement program.但是我测试的会报错。试了更高版本的，也有错误，虽然不一样。所以用3.10就好。
2025-03-29 17:49:49
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原创 ase test出现numpy版本报错
ase的安装ase是理论计算过程中常用的python包（一般利用来安装。安装完ase 以后，运行ase test。是一个numpy的报错。解决方案1、通过pip list命令，发现numpy安装的是最新的版本2.1.2。2、到找一个历史版本，比如1.*的版本。3、把原来的numpy卸载掉，安装一个版本的然后再运行ase test就可以通过了^_^
2025-03-29 17:44:52
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原创 文献管理软件-Endnote、mendeley、Zotero 或者其他？
所以X7 X8 X9的用户要不要用，看自己的喜好喽，X7的用户升级到8或者9，体验差别不大。如果在Linux系统，或者基于Debian或Ubuntu的国产网信系统上也要用的话，Endnote可以通过新建不同的Library，独立的管理不同方向的文献集。Endnote虽然收费，但有非常多的高校、研究所的图书馆都已经买了正版，Mendeley的特长是基于云端，如果只是用本地功能，不如其他的体验好。Zotaro免费，笔记功能强大，有很多好玩好用的插件和自己的社区。还是会发挥很大的作用，建议使用。
2025-03-29 17:09:23
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原创 阅读caj文件的轻量化软件-标准阅读器
知网的毕业论文一般都是caj格式的，cajviewer比较大，打开文件有点卡，有的版本右上角还有个广告。推荐知网有个轻量化的软件–标准阅读器，只有30多M，打开caj文件很快。
2025-03-26 09:20:14
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原创 Virtualbox7.0以上版本安装报错：Invalid installation directory
virtualbox7.0以上版本，如果想改变一下安装目录，比如安装D盘，会出现报错无法安装。官方给出了相应的解决方案：https://www.virtualbox.org/manual/ch02.html#install-win-installdir-req。
2025-03-26 08:50:14
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原创 【Latex编译器推荐（面向初学者或者懒得折腾的朋友，主要针对windows用户）】-Markdown编辑
大家平时用的最多的排版工具想必就是Microsort的Word或者WPS了，所见即所得，Latex是另外一种排版工具，需要编译才可以生成pdf。相信大家在投稿的时候，会发现很多杂志都提供的tex template。至于Latex好还是word好，这个已经有很多讨论了，不在此多讨论。简单说下，Natue Science不会因为你是word还是latex排版拒绝你。Latex的主要优势是：如果Latex命令掌握非常熟练，在排版公式非常多的论文或者书籍时，比word要快速、稳定、美观的多。
2025-03-25 13:01:55
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原创 用VASP计算氢分子的能量
氢气分子的解离能，也就是结合能,根据资料中给出的是约4.48eV。(G. Kresse & J. Hafner, Surface Sci. 459 (2000) 287)为此，首先要计算一个氢气分子的孤立能量，再减去两个孤立氢原子能量，将得到氢气分子的结合能。先计算单个原子能量，选取PAW_PBE文件夹下的H下面的POTCAR用到的其他输入文件如下：INCAR: SYSTEM ...
2020-04-13 21:30:23
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原创 Optical Properties of Materials Calculated from VASP
Dielectric properties of SiCTaskStatic dielectric propertiesDensity functional perturbation theoryTaskCalculation of the static and frequency dependent dielectric properties of SiC.Static dielectri...
2018-10-22 11:11:30
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空空如也
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