RNA的.fasta数据转换为数字数据

最新推荐文章于 2022-11-20 16:38:47 发布

BlueFishMan

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分类专栏：毕业设计文章标签： python 生物数据

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/qq_14974995/article/details/70477741

这篇博客介绍了如何将RNA的.fasta数据转换为数字数据，重点在于将.fasta格式的RNA_m5c数据集手动转化为.csv格式，并通过Anaconda_Spyder使用Python实现这一过程，最终生成了带有标签的m5c_N.csv和m5c_P.csv文件。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

特征转换：.fasta->.numerical

将.fasta格式的数据转换为数字格式的数据

特征转换fasta-numerical

.fasta格式1

在生物信息学中，FASTA格式（又称为Pearson格式），是一种基于文本用于表示核苷酸序列或氨基酸序列的格式。在这种格式中碱基对或氨基酸用单个字母来编码，且允许在序列前添加序列名及注释。— [百度百科]

RNA_m5c数据集

Supporting Information S1. The benchmark dataset consists of a positive dataset and a negative dataset. The former contains 120 true m5C site containing sequences with the m5C site in the center, while the latter contains 120 false m5C site containing sequences. Each of these segments is 41-bp long.

m5c_P.fasta

I. 120 true m5C site containing sequences