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代码分析 | 单细胞转录组clustering详解
聚类可视化NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Lim...原创 2020-04-20 11:11:52 · 5084 阅读 · 1 评论 -
代码分析 | 单细胞转录组数据整合详解
两种整合方法详解NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析(Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析(ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析(重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-step) - Lim...原创 2020-04-20 11:09:28 · 10160 阅读 · 1 评论 -
代码分析 | 单细胞转录组质控详解
前言NGS系列文章包括NGS基础、转录组分析 (Nature重磅综述|关于RNA-seq你想知道的全在这)、ChIP-seq分析 (ChIP-seq基本分析流程)、单细胞测序分析 (重磅综述:三万字长文读懂单细胞RNA测序分析的最佳实践教程 (原理、代码和评述))、DNA甲基化分析、重测序分析、GEO数据挖掘(典型医学设计实验GEO数据分析 (step-by-ste...原创 2020-04-17 20:47:50 · 10823 阅读 · 0 评论 -
“单细胞”前瞻 |新型微滴反应筛选技术&ATAC-seq数据分析新篇章
来源:www.im.cas.cn/xwzx2018/kyjz/201910/t20191009_5405438.html http://life.tsinghua.edu.cn/publish/smkx/11191/2019/20191009170114780764738/20191009170114780764738_.html新型微滴反应筛选技术中科院微生物所微生物资源前期开发国...原创 2019-10-28 19:37:22 · 876 阅读 · 0 评论 -
Hemberg-lab单细胞转录组数据分析(一)
在别人的电子书,你的电子书,都在bookdown一文中推荐过这一篇教程(https://hemberg-lab.github.io/scRNA.seq.course),从2016年一直更新到2018年,是入门单细胞分析的十分适合的文档。为了进一步促进学习,生信宝典申请并组织翻译这篇教程,将在公众号陆续推出。最后会有整合版以网页和PDF格式发布于易生信平台。关于课程采用高通量测序技术获取单细胞水...原创 2019-04-22 17:04:03 · 1850 阅读 · 0 评论 -
七龙珠 |召唤一份单细胞数据库汇总
每次分析自己的单细胞数据后,都让我产生无限的遐想与yy,总感觉不对劲也说不上是哪里,于是总想找别人发表的单细胞数据分析一下,第一步是检索,检索检索。。。。睡着了……那么,就总结一下收录有单细胞发表数据的数据库吧,可以帮助大家减少看文献的负担哈!(如何快准狠地找到相关领域的经典文献?)单细胞数据库汇总1. PanglaoDB以上是该单细胞数据库的界面,左边有不同的检索方式...原创 2019-09-16 11:33:35 · 5682 阅读 · 1 评论