LAMMPS表面生成：用MATLAB构造任意不规则表面的“行走晶格”

pytorchCode

于 2023-09-19 08:50:34 发布

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本博客介绍如何利用MATLAB生成任意不规则的行走晶格表面，以用于LAMMPS分子动力学模拟。首先，通过MATLAB代码创建并可视化表面，然后导出为LAMMPS输入文件，以便在LAMMPS中进行表面生成模拟。提供的示例代码可作为起点，根据实际需求进行调整。

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在本文中，我们将使用MATLAB编写代码来生成任意不规则表面，以模拟行走晶格的表面生成过程。我们将使用LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator）作为分子动力学模拟软件，通过生成原子坐标文件并使用LAMMPS进行表面生成模拟。

在开始之前，请确保您已经安装了MATLAB和LAMMPS，并将其正确配置在您的计算机上。

首先，我们将使用MATLAB生成一个不规则的行走晶格表面。以下是一个示例代码：

% 生成不规则表面的行走晶格

% 定义表面尺寸和步长
surface_size = 10; % 表面的尺寸
step_size = 0.5; %

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