三维图像的Dice系数计算

最新推荐文章于 2024-05-29 13:45:45 发布

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#深度学习 #机器学习 #神经网络

该博客介绍了如何使用Python计算三维图像分割的Dice系数，以评估预测网络的准确性。通过加载.nii文件，对每个类别分别计算Dice得分，并排除空类别，最终取平均值得到整体Dice系数。示例代码展示了从.nii文件读取预测和目标数据，以及计算所有样本的平均Dice分数的过程。

项目场景：三维图像的Dice系数计算

在这里插入图片描述

问题描述：

通常我们用目标分割网络，预测结果后。为了得知网络的准确度，可以计算其Dice系数，通过比较其系数，可以得知网络的准确性。

import numpy as np
import nibabel as nib

def cal_subject_level_dice(prediction, target, class_num=2):# class_num是你分割的目标的类别个数
    '''
    step1: calculate the dice of each category
    step2: remove the dice of the empty category and background, and then calculate the mean of the remaining dices.
    :param prediction: the automated segmentation result, a numpy array with shape of (h, w, d)
    :param target: the ground truth mask, a numpy array with shape of (h, w, d)
    :param class_num: total number of categories
    :return:
    '''