LD不能用了

最新推荐文章于 2020-11-26 16:52:39 发布
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LD不能用了。。。以后怎么学习？！！！！！



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LD衰减图解读（LD decay）
hs6605015的博客
07-19 2万+
1.基础概念的解读 要理解LD衰减图，我们就必须先理解连锁不平衡（Linkage disequilibrium，LD）的概念。连锁不平衡是由两个名词构成，连锁+不平衡。前者，很容易让我们产生概念混淆；后者，让这个概念变得愈加晦涩。因此从一个类似的概念入手，大家可能更容易理解LD的概念，那就是基因的共表达。 基因的共表达，通常指的是两个基因的表达量呈现相关性。比较常见的例子就是：转录组因子和靶基因间的关系。因为转录因子对它的靶基因有正调控作用，所以转录因子的表达量提高会导致靶基因的表达量也上调，两者往往存在正
使用plink进行连锁不平衡分析
庐州月光的博客
06-23 1万+
欢迎关注"生信修炼手册"！plink是进行连锁不平衡分析的常用工具之一，需要两个基本的输入文件，后缀分别为ped和map。ped文件格式在之前的文章中已经详细介绍过，这里...
haploview画出所有SNP的LD关系图
weixin_33910385的博客
05-19 3357
有时候我们想画出所有SNP的LD关系图，则需要在命令行添加“-skipcheck”命令行，如下所示： java -jar Haploview.jar -skipcheck -n -pedfile 800kb1.ped -info 800kb1.info -png -out 800kb 　这样就不需要经过haploview的过滤标准了。 如果只想过滤某个标准，则可参看下来参数 ...
Levenshtein Distance （LD算法） 编辑距离算法原理
自律带来自由
04-09 6972
莱文斯坦距离，又称Levenshtein距离，是编辑距离的一种。指两个字串之间，由一个转成另一个所需的最少编辑操作次数。允许的编辑操作包括：将一个字符替换成另一个字符，插入一个字符，删除一个字符。 LD算法原理： 算法目的：计算出两字符序列的编辑距离，同时也能求出两序列的匹配序列 假设： 比对的俩序列为： 则两序列的长度分别为len(A) = n，Len(B)=m； LD(A,B)：字符...
关联分析LD计算的问题
samhuairen的专栏
01-25 1万+
说道关联分析，就要谈到连锁不平衡，连锁不平衡的衰减。 那么什么就是LD的衰减呢， 简单的说就是群体在经历了几百年或是更多年的历史重组之后在基因组上形成的重组块（block). 这些block 紧密的排列在基因组染色体的位置上。 有的地方block 比较大， 有的地方block比较小。 这个大小的意思就是延伸的长还是短。平均的延伸的长度决定了我们定位基因的精度。 延伸的越短，定位的精度越高。 延伸的
精选资源
Ubuntu环境QT问题 /usr/bin/ld: 找不到 -lGL(已解决)
01-08
安装完qt之后，构建项目就会出现:/usr/bin/ld: 找不到 -lGL 因为缺少了libGL环境，此时更新libGL环境 执行此命令sudo apt-get install libgl1-mesa-dev 执行完命令会提示错误，说依赖关系被破坏 因为是源有问题，...
雷赛LD5-400系列低压伺服系统使用手册.pdf
07-15
使用过程中，应接入紧急停止电路，确保在发生事故时设备能立即停止运转，并且在复位报警前确认运行信号已关断。 故障处理方面，手册警告用户在伺服驱动器断电后，高压仍会保持一段时间，因此断电后5分钟内请勿拆卸...
电源技术中的LD7537特性与应用
11-03
首先，LD7537采用高电压CMOS工艺制造，这种工艺赋予了它卓越的静电放电（ESD）保护能力，能够防止在操作或组装过程中由于静电引起的潜在损坏，从而提高产品的耐用性和使用寿命。 其次，该芯片拥有极低的启动电流，...
ld14 接收雷达数据处理及转换
10-18
总的来说，"ld14 接收雷达数据处理及转换"涵盖了激光雷达数据的采集、预处理、解码、定位、融合以及应用等多个环节，这些技术是现代智能系统中不可或缺的部分，特别是对于需要实时环境感知和决策的自动驾驶系统。...
精选资源
海尔LD40U3200刷机程序_机编DH1TJ000200_务必确认机编一致
12-23
LD40U3100 LD40U3200升级操作说明 1、LD40U3100 LD40U3200是同一版程序 2、升级时不要更改文件名称，将U盘中原来其他型号的的install.img升级文件删除 3、再将40的升级程序L_RTD2649.img拷贝到U盘 4、将U盘插上，...
LDheatmap | SNP连锁不平衡图（LD）可视化，自己数据实现版！
weixin_39556044的博客
05-09 8793
本文首发于“生信补给站”，https://mp.weixin.qq.com/s/Gl6BChxSYbSHMo9oMpufPg 连锁不平衡图，用来可视化不同SNP之间的连锁程度，前同事间俗称“倒三角”图。 本文使用自己的数据，因为安装R包后使用内置数据集运行出结果较容易，但是自己的数据就可能会有一些不大不小的“坑”，我替你们趟了。。。 一 载入R包 数据 数据为内置CEUData保存后，进行了“细微”的处理（去掉SNP碱基之间的“/”），这种基因型文件很常见； library("LDheatmap") #.
SNP连锁不平衡图（LD）可视化R包LDheatmap的使用
热门推荐
高锦的博客
09-20 1万+
理解SNPs之间的联系或连锁不平衡（LD）模式对于单体型的选择具有重要作用，然而，对于密集的SNP图谱，随着区域内SNPs数量的增加，很难直接从复杂的VCF文件来看出SNPs间的连锁不平衡关系。LDheatmap就是这样一个能够可视化SNPs之间连锁不平衡关系的R包。 先举个小例子： 随机创建100个样本5个SNPs的基因型矩阵，并实现LD热图： rm(list=ls()) set.see...
Dnasp计算LD
GRC
09-01 2967
Dnasp计算LD Table of Contents 1 Dnasp 计算LD 1 Dnasp 计算LD Dnasp有很多的功能，现在主要来记录其计算LD的功能。 首先File——然后打开data——然后在Data中Format里设 置格式，也就是你读入的文件是什么样子的，进行一个 描述。我们这里选DNA，Haploid，然后OK，然后到Ana lysis找到
QTL定位原理学习
samhuairen的专栏
11-26 3984
一直在学习QTL，数量遗传学，看了很多书，文献，但自己一直是模模糊糊，总觉得只知道其一，不知道其二，今天看王健康老师写的基因定位与育种设计，让我又有了一种从头学习一边的冲动，我大体看了我认为比较重要的两章，写了一个自学的提纲，希望能够填充满这个内容。提纲如下：欢迎有共同爱好者填写其中的内容。 标记和图谱构建 如何构建图谱 构建图谱用什么方法 如何用R实现 F2群体单标记的t检验 什么是t检验 什么是t分别 什么是正态分布 如何计算加性和显性效应，如何检测 说‘人话’的例子 R语言代码实现..
python,UPD,socket(一) 使用udp 发送消息
perfectnihil的博客
11-04 3559
Section1   创建socket # -*- coding: utf-8 -*- from socket import * mSocket = socket(AF_INET,SOCK_DGRAM) 其中AF_INET 指的是IPV4 SOCK_DGRAM 指的是UPD Section2 发送信息 # -*- coding: utf-8 -*
python,UPD,socket(二) 使用udp 接收消息
perfectnihil的博客
11-04 2998
# -*- coding: utf-8 -*- Section1 接收消息 from socket import * mSocket = socket(AF_INET,SOCK_DGRAM) mSocket.bind(("",60060)) while True: result = mSocket.recvfrom(1024) print(result) 这种条件下
ping 与 防火墙
perfectnihil的博客
11-03 1517
1 防火窗开启 C:\Users\superDy>ping 192.168.232.128 Pinging 192.168.232.128 with 32 bytes of data: Request timed out. Request timed out. Request timed out. Request timed out. Ping statistics
手机流量网络
perfectnihil的博客
11-09 309
发现一个现象，如果用手机做路由，使用手机流量的话， pip install 一些东西 会很快，比用电信 的网快多了。。。 -
单播，多播，广播
perfectnihil的博客
11-09 260
单播： 一对一 多播：一对多 广播：一对所有
ld剪枝能不能让qq图降下来
最新发布
08-06
还要指出LD剪枝的局限性，比如可能丢失弱信号，以及不能替代分层分析等更高级的方法。 最后用具体案例对比会更有说服力，比如展示剪枝前后QQ图lambda值的变化，1.05降到1.01这种典型改进。用户可能后续还需要知道...
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