R语言中等高线图与热力图的横纵坐标对应问题

本文介绍如何使用R语言创建热力图和等高线图,并展示了具体的代码实现步骤。通过pheatmap包绘制了带有特定颜色设置的热力图,并通过filled.contour函数生成了等高线图。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

>test = matrix(rnorm(200), 20, 10)

>test[1:10, seq(1, 10, 2)] = test[1:10, seq(1, 10, 2)] + 3
> test[11:20, seq(2, 10, 2)] = test[11:20, seq(2, 10, 2)] + 2
> test[15:20, seq(2, 10, 2)] = test[15:20, seq(2, 10, 2)] + 4
> colnames(test) = paste("Test", 1:10, sep = "")
> rownames(test) = paste("Gene", 1:20, sep = "")

此时test是一个20*10列的矩阵,行名为Gene开头,列名为Test开头

1、对于热力图来说:

> library(pheatmap)
> pheatmap(test,cluster_row = FALSE,cluster_col=FALSE)

图形为:(行列和原矩阵的位置一一对应)


2、对于等高线图来说

> filled.contour(test, color=rainbow,plot.axes=contour(test, add=T))

图形为:(图形刚好为上述热力图逆时针旋转90度,即横轴从左到右依次为Gene1-Gene20,纵轴从上到下依次为Test10-Test1,对应矩阵为原矩阵逆时针旋转90度)


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