R语言作快速聚类时画聚类图要突出某一个点

最新推荐文章于 2024-07-19 08:15:00 发布
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本文通过使用R语言的fpc包实现了一个基于鸢尾花数据集的聚类分析案例。具体步骤包括加载必要的库文件，从鸢尾花数据集中选取数值特征进行聚类分析，并利用discrproj函数投影到低维空间进行可视化展示。最后，通过在图表中突出特定的数据点来直观地展示聚类效果。

library(fpc)

iris2=iris[,-5]

kmeans=kmeans(iris2,3)

cx <- discrproj(iris2,kmeans$cluster)$proj  #这个就是plotcluster里的核心函数

plot(cx,pch=21,col=kmeans$cluster)

points(cx[150,1],cx[150,2],pch="o",col=2,cex=2) #这个根据所要突出点的cx坐标

结果如下图：（红色圈圈出了所要突出的点的类别和位置）



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调取用于单细胞数据一致聚类的SC3包的小程序 包含详细的说明
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Chapter 10 Cluster Analysis本篇是第十章，内容是聚类分析。由于之后的几章是典型的分析方法。而且在14章的案例里面可能不会体现，所以内容里会渗透较多的R语言操作。
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