编译HDF5，并安装

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#HDF5 

wget    //这个地址你们自行替换，这个事 1.8.3版本的
tar -zxvf hdf5-1.8.3.tar.gz
./configure --prefix=/usr/local/hdf5-1.8.3/
make
make check                # run test suite.
make install
make check-install        # verify installation.
QGIS编译（跨平台编译）044：HDF5编译（Windows、Linux、MacOS环境下编译）
LuckyHanMo的博客
07-20 460
QGIS编译；HDF5编译（Windows、Linux、MacOS环境下编译）
【WRF安装】WRF编译错误总结1：HDF5库包安装
WW、forever的博客
12-14 1805
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HDF5编译安装
kmblack1的专栏
11-09 3113
zlib、szip、HDF5在windows上编译安装
h5py快速入门指南：HDF5文件操作基础教程
最新发布
gitblog_01132的博客
06-25 426
h5py快速入门指南：HDF5文件操作基础教程 安装h5py h5py是Python中操作HDF5文件的工具包，安装方式多样： 使用Anaconda/Miniconda安装（推荐科学计算用户）： conda install h5py 使用pip安装（适用于大多数用户）： pip install h5py 从源码安装（需要编译环境）： 需要先安装HDF5库，然后通过Python se...
Ubuntu系统下交叉编译hdf5
IT菜鸟
02-14 533
Ubuntu系统下交叉编译hdf5
hdf5编译、使用
novanova2009的博客
04-14 5997
1 编译安装库文件 hdf5下载，首先要注册。注册后下载windows下编译好的库，很费时间，只能通过浏览器，连接速度只有十几k/s。编译好的库80M+。也可以下载源码自己编译。 编译可参考该指南。https://portal.hdfgroup.org/display/support/Building+HDF5+with+CMake 首先要安装cmake 3.10+。然后执行源码目录中的ba...
编译线程安全的HDF5库
weixin_42849849的博客
06-11 449
希望这些信息对您有所帮助！如需更详细的指导，可以参考HDF5官方文档中的线程安全部分。在配置HDF5时，需要启用线程安全特性。
HDF5库，Windows编译好的库
07-10
这个压缩包提供的预编译库文件（HDF5-1.12.2-win64）意味着用户可以直接将这些库文件链接到他们的项目中，而无需自行编译HDF5源代码，大大简化了开发流程。 总的来说，这个“HDF5库，Windows编译好的库”是一个非常...
可以联合编译GDAL、HDF4、HDF5、Geos、netCDF、Proj.4的源文件
09-08
总之，联合编译GDAL、HDF4、HDF5、Geos、netCDF和Proj.4是一项复杂但有价值的工作，它为开发地理空间应用提供了坚实的基础。通过理解这些库的功能和相互关系，你可以更好地利用它们来实现复杂的地理空间操作，例如...
编译hdf5解析库
06-13
总的来说，编译HDF5解析库是一项涉及多步骤的任务，需要对编译工具、依赖管理和编程有基本的理解。正确配置和编译HDF5库将为气象数据分析提供强大的底层支持，使你能够高效地处理大规模的科学数据。
【LINUX-centos7.9系统下数学三方库-HDF5的编译安装调用】
Linux CAE Compiler HPC
03-15 1687
本系列主要讲解在linux-centos7.9系统下，对于开源的流体和结构软件编译过程中经常调用的数学库软件进行源码编译安装调用的内容，这一篇主要介绍数学库中的HDF5的源码基本编译，以及不同参数下各种不同版本的编译内容。
hdf5安装软件
10-20
hdf5 在linux下的安装包 如果想在linux下解析hdf5文件 需要 加载该库文件 并编译生成。
hdf5 Linux下的安装包 以及make文件
07-20
hdf5 在linux下的安装包 如果想在linux下解析hdf5文件 需要 加载该库文件 并编译生成。a文件
HDF5 windows 安装
02-12
HDF5 windows exe 文件安装，直接默认路径安装，然后即可使用h5py
hdf5安装包
07-23
安装caffe的依赖包之一，官网下载太慢了，上传一个方便大家。
mingw编译的hdf5
09-22
windows下Cmake使用Mingw编译的HDF5，版本为1.10.1，可用于Qt开发
Ubuntu安装HDF5
qq_40622955的博客
01-12 1915
下载源代码解压进入解压后的目录编译依次执行下面的命令输出。
hdf5安装
qq_27481087的博客
12-22 625
apt-get install libhdf5-serial-dev
Windows下使用MinGW+CMake编译HDF5
weixin_42583196的博客
07-03 2734
最近需要使用hdf插件解析数据，网上查了很多资料，都一知半解，Windows平台上大部分都是讲解如何使用VS对源码进行编译，项目需要使用MinGW，所以经过几天的研究，最终编译成功，现将编译过程记录如下......1、安装MinGW，本机使用的版本是MinGW482版本。2、安装CMake，HDF5对CMake版本有要求，安装>=要求的版本就行。3、去HDF5官网（https://suppo...
如何重新编译HDF5并启用Fortran支持
06-24
<think>我们正在处理用户关于重新编译HDF5库并启用Fortran支持的问题。根据用户需求，我们需要提供配置选项和编译指南。用户之前的问题和引用中提到：引用[1]：HDF5编译安装。注意：ctest运行完成后即表示已经编译并且已安装。根据HDF5options.cmake中的CMAKE_INSTALL_PREFIX配置，hdf5已经安装至E:/library/hdf5,如果没有安装会在myhdfstuff中生成一个HDF5-1.14.x-win64.zip,解压至安装目录即可。4编译安装zlib以下所有命令均在“x64NativeToolsCommandPromptforVS2019”命令行中执行[^1]。引用[2]：MBPT计算软件berkeleyGW编译安装。和yambo一样，berkeleyGW支持GW-QP和GW-BSE，不同的是berkeleyGW没有TDDFT。二者都支持QE和wannier90接口。教程方面yambo教程齐全，但有点乱，但输入文件可自动产生，使用很是方便。berkeleyGW则逻辑清晰，使用起来较为方便。[^2]。但用户当前的需求是重新编译HDF5并启用Fortran支持。因此，我们将重点放在如何配置和编译HDF5以支持Fortran。步骤：1.准备环境：确保有Fortran编译器（如gfortran）和CMake。2.获取HDF5源代码。3.配置编译选项，特别是指定启用Fortran支持。4.编译和安装。注意：在Windows和Linux下步骤可能有所不同。用户引用中提到了Windows下的编译（VS2019命令行），但用户没有明确操作系统，因此我们将分别说明。由于用户提到“重新编译”，可能已经尝试过但没有启用Fortran，所以我们将详细说明如何启用Fortran。根据HDF5官方文档，启用Fortran支持需要在配置时添加特定的选项（对于CMake）。我们将分别提供Linux（使用gcc和gfortran）和Windows（使用VisualStudio和IntelFortran或gfortran）的指南。由于引用[1]中使用了CMake，并且是在Windows下，我们将以Windows为主，同时补充Linux。详细步骤：Windows（使用VisualStudio和IntelFortran或gfortran）：1.打开“x64NativeToolsCommandPromptforVS2019”（或相应版本的命令行）。2.确保Fortran编译器在PATH中（如果使用IntelFortran，需要先运行Intel编译器的环境设置脚本；如果使用gfortran，确保已安装并加入PATH）。3.进入HDF5源代码目录，创建一个构建目录（例如build）并进入。4.运行CMake配置命令，指定启用Fortran，并设置安装路径等。示例命令：```cmake..-G"VisualStudio162019"-Ax64-DHDF5_BUILD_FORTRAN:BOOL=ON-DCMAKE_INSTALL_PREFIX="E:/library/hdf5"```注意：这里-G指定生成器，-A指定平台（x64），-DHDF5_BUILD_FORTRAN:BOOL=ON启用Fortran支持，-DCMAKE_INSTALL_PREFIX指定安装路径。5.然后使用CMake构建并安装：```cmake--build.--configRelease--targetinstall```如果使用gfortran（例如通过MinGW-w64或MSYS2安装），则需要注意生成器可能不同，可以使用“MinGWMakefiles”生成器。Linux（使用gcc和gfortran）：1.确保安装了gcc、g++、gfortran和cmake。2.进入HDF5源代码目录，创建构建目录并进入。3.运行：```cmake..-DHDF5_BUILD_FORTRAN:BOOL=ON-DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/path/to/install```4.然后：```makemakeinstall```注意：在配置过程中，如果遇到Fortran编译器未找到，需要检查Fortran编译器是否安装正确，并确保在PATH中。此外，用户可能还需要依赖库（如zlib，如引用[1]中提到的），需要在配置时指定zlib的位置（如果不在系统默认路径）。例如：-DZLIB_ROOT:STRING="E:/library/zlib"或-DZLIB_LIBRARY:STRING="E:/library/zlib/lib/zlib.lib"-DZLIB_INCLUDE_DIR:STRING="E:/library/zlib/include"在Linux下，如果zlib安装在非标准路径，可以设置环境变量PKG_CONFIG_PATH，或者在CMake时指定-DZLIB_LIBRARY和-DZLIB_INCLUDE_DIR。生成相关问题：1.如何验证HDF5的Fortran支持是否成功启用？2.在编译HDF5时遇到Fortran编译器未找到的错误，如何解决？3.如何在CMake配置中指定其他依赖库（如zlib,szip等）？4.如何为HDF5启用并行IO（MPI）支持？根据上述思路，我们组织回答。</think>### 重新编译HDF5启用Fortran支持指南 #### 1. **环境准备** - **Fortran编译器**：安装与系统匹配的Fortran编译器（如Linux用`gfortran`，Windows用`Intel Fortran`或`MinGW-w64`的gfortran） - **依赖库**：确保`zlib`已正确安装（参考[^1]的zlib编译步骤） - **工具链**： - Linux：安装CMake、make、gcc/g++ - Windows：使用**x64 Native Tools Command Prompt for VS 2019**（或其他对应VS版本） #### 2. **配置关键选项** 通过CMake配置时添加以下核心参数： ```bash # 启用Fortran支持（核心选项） -DHDF5_BUILD_FORTRAN:BOOL=ON # 指定Fortran编译器路径（可选，若自动检测失败） -DCMAKE_Fortran_COMPILER="path/to/fortran_compiler" # 设置安装路径（参考[^1]） -DCMAKE_INSTALL_PREFIX="E:/library/hdf5" # Windows示例 -DCMAKE_INSTALL_PREFIX="/usr/local/hdf5" # Linux示例 # 若需zlib支持（参考[^1]） -DHDF5_ENABLE_Z_LIB_SUPPORT:BOOL=ON -DZLIB_ROOT:STRING="zlib安装路径" ``` #### 3. **完整编译流程（Windows示例）** ```bash # 在VS命令行中执行 cd hdf5_source_dir mkdir build && cd build # CMake配置（启用Fortran） cmake .. -G "Visual Studio 16 2019" -A x64 ^ -DHDF5_BUILD_FORTRAN:BOOL=ON ^ -DCMAKE_INSTALL_PREFIX="E:/library/hdf5" ^ -DHDF5_ENABLE_Z_LIB_SUPPORT:BOOL=ON ^ -DZLIB_ROOT:STRING="E:/library/zlib" # 编译并安装 cmake --build . --config Release --target install ``` #### 4. **验证Fortran支持** 安装后检查： ```bash # 检查生成的库文件 ls lib/*fortran* # 应有libhdf5_fortran.dll/libhdf5_fortran.a # 运行测试用例（可选） ctest -R fortran # 执行Fortran相关测试 ``` #### 5. **常见问题解决** - **Fortran编译器未找到**： 显式指定路径 `-DCMAKE_Fortran_COMPILER="C:/MinGW/bin/gfortran.exe"` - **ABI兼容问题**： 确保C和Fortran编译器版本兼容（建议使用同套工具链） - **并行编译失败**： 添加 `-DHDF5_BUILD_CPP_LIB:BOOL=OFF` 减少依赖冲突 > 提示：完整选项参考[HDF5官方CMake文档](https://portal.hdfgroup.org/display/support/CMake+Build+System+for+HDF5)
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