因命名不规范，耗了3个小时

最新推荐文章于 2025-09-06 16:31:27 发布
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本文记录了一次因为命名不规范导致的问题排查经历，耗时长达3小时。作者因此决定开设优快云博客，分享经验和教训。
因命名不规范，耗了3个小时，特因此开通优快云博客，密码就是那两个混淆的类型，relR，和tmpR
Mysql学习总结（77）——温故Mysql数据库开发核心原则与规范
科技D人生
09-12 4830
一、核心原则 1、尽量不在数据库做运算 俗话说：别让脚趾头想事情，那是脑瓜子的职责。作为数据库开发人员，我们应该让数据库多做她所擅长的事情。尽量不在数据库做运算，复杂运算移到程序端CPU，尽可能简单应用MYSQL。 举例：在mysql中尽量不要使用如：md5()、Order by Rand()等这类运算函数 2、尽量控制单表数据量 大家都知道单表数据量过大后会影响数据查询效率，严重情况下...
从0到1搭建提示工程架构：3个真实项目案例拆解，助你快速晋升架构师
AI架构师小马
10-02 873
推荐读《系统之美》——提示工程架构的本质是“系统设计”，你得学会用“整体视角”看问题，而不是“局部优化”。在AI时代，提示工程架构师就像“建筑设计师”——你不需要自己砌砖（写prompt），但你要设计蓝图（架构）、选材料（模型）、定规范（prompt框架）、保证质量（评估）。当你能从0到1搭建提示工程架构时，你就不再是“AI的使用者”，而是“AI能力的设计者”——这就是你晋升架构师的核心竞争力。
【Java进阶营】Java项目开发规范（1）—方法命名规范
hong1008611的博客
05-01 2197
编程5分钟，起名2小时。 场景实战 方法应该具有单一职责特效，通过一个比较好的命名来实现较高的可读性。即实现less is more。那么平时在开发中如何对一些常见的方法来进行命名？ 方法命名采用小驼峰的形式，首字小写，往后的每个单词首字母都要大写。和类名不同的是，方法命名一般为动词或动词短语，与参数或参数名共同组成动宾短语，即动词 + 名词。一个好的函数名一般能通过名字直接获知该函数实现什么样的功能。 举几个常见的例子： 例如checkXxx或者validateXx方法，给人的职责便是校验业务，不推荐
技术概念规范
Claer_XX的博客
07-10 865
技术概念规范 更多请见个人主页https://www.bajins.com 目录技术概念规范flag编程范式设计模式及原则数据结构与算法算法复杂度数据传输模型网络通信协议HTTPswitchdirectory和folder区别进制逻辑运算符字符编码Cron表达式命名规范GNU风格版本规则多线程线程数量控制缓存锁和事务HTTP授权认证OAuth2和JWT区别与联系加密哈希 flag 代码不是靠死记硬背，而是不停的写、不停的思考，在反复的练习中熟练掌握的。 编程需要学习记住的是：不同的场景中一些实现方式的原理
一个小时学会MySQL数据库
weixin_30323961的博客
12-30 233
下载网站:www.SyncNavigator.CN客服QQ1793040---------------------------------------------------------- 关于HKROnline SyncNavigator 注册机价格的问题 HKROnline SyncNavigator 8.4.1 非破解版 注册机 授权激活教程 ...
【转载】一个小时学会MySQL数据库
weixin_33862993的博客
02-20 398
一个小时学会MySQL数据库 目录 一、数据库概要 1.1、发展历史 1.1.1、人工处理阶段 1.1.2、文件系统 1.1.3、数据库管理系统 1.2、常见数据库技术品牌、服务与架构 1.3、数据库分类 1.3.1、关系型数据库 1.3.2、非关系型数据库 1.4、数据库规范化 1.4.1. 什么是范式 1.4.2. 三大范...
转载 一个小时学会MySQL数据库(4)
Museions的开心博客
04-11 622
常用的SQL,常用的数据库操作语句...
linux的定时任务有多耗资源,linux定时任务的一些相关操作汇总
weixin_39716043的博客
05-14 306
本人搜罗各大网站并测试了相关定时任务的操作方便大家进行查阅和操作。1、cron介绍我们经常使用的是 crontab 命令是cron table的简写，它是cron的配置文件，也可以叫它作业列表，我们可以在以下文件夹内找到相关配置文件。1.1、cron相关目录/var/spool/cron/ 目录下存放的是每个用户包括root的crontab任务，每个任务以创建者的名字命名/etc/crontab ...
软著源代码要求每页不低于50行？1个工具自动排版！
aigccleaner的博客
09-06 1119
针对软著申请中源代码准备耗时、易错等痛点，语流软著宝提供AI驱动的智能解决方案。该工具30分钟内自动生成3000+行原创代码、操作说明书等全套材料，满足四大核心要求：代码量、独创性、功能一致性和格式规范。相比传统方式，其优势在于AI从零生成专属代码避免查重，智能联动确保文档代码匹配，自动合规排版，并内置预审系统规避70%常见错误。实际应用中可节省90%时间，通过率超90%，适用于开发者、企业及高校群体，是当前提升软著申报效率的最佳选择。
javascript 代码规范
weixin_34206899的博客
04-04 110
目录 1.为什要遵守代码规范 2.编写代码需遵守的几个原则 3.编码规范(Coding Conventions) 4.命名规范(Naming Conventions) 5.css基础class类 1.为什要遵守代码规范 软件bug的修复是昂贵的，并且随着时间的推移，这些bug的成本也会增加，尤其当这些bug潜伏并慢慢出现在已经发布的软...
JVM高频面试基本问题与知识点整理
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调试信息输出优化，基于PlatformIO的日志系统统一管理方案（企业级日志规范落地）
# 1. 企业级日志系统的核心价值与PlatformIO生态定位 在嵌入式系统开发中，日志不仅是调试的“眼睛”，更是运维监控、故障溯源和... 日志系统设计的理论基础与规范体系 在现代嵌入式系统和物联网（IoT）架构中，日
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动态覆盖的分布式策略，具有有限感知能力.zip
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1.版本：matlab2014a/2019b/2024b 2.附赠案例数据可直接运行。 3.代码特点：参数化编程、参数可方便更改、代码编程思路清晰、注释明细。 4.适用对象：计算机，电子信息工程、数学等专业的大学生课程设计、期末大作业和毕业设计。
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基于双目标 UCB 控制启发式算法的主动磁悬浮轴承 PID 隐式模型优化方法-基准函数测试（Matlab代码实现）
12-04
内容概要：本文提出了一种基于双目标UCB控制启发式算法的主动磁悬浮轴承PID隐式模型优化方法，并通过基准函数测试验证其有效性。该方法结合了多目标优化与启发式搜索策略，旨在提升主动磁悬浮轴承控制系统中PID参数整定的精度与稳定性，利用Matlab进行仿真代码实现，展示了在基于双目标 UCB 控制启发式算法的主动磁悬浮轴承 PID 隐式模型优化方法——基准函数测试（Matlab代码实现）复杂非线性系统建模与优化方面的应用潜力。; 适合人群：具备一定控制理论基础和Matlab编程能力的高校研究生、科研人员及从事自动化、机械电子工程等领域研发工作的技术人员。; 使用场景及目标：①用于主动磁悬浮轴承系统的高性能控制设计；②为PID控制器参数优化提供基于双目标UCB启发式算法的新思路；③适用于需要高精度、强鲁棒性控制的工业场景，如高速旋转机械、精密制造装备等。; 阅读建议：建议读者结合Matlab代码深入理解算法实现细节，重点关注双目标优化机制与UCB启发式策略的融合方式，并可通过替换不同基准函数进行扩展实验，进一步掌握其在实际控制系统优化中的调参技巧与适应性分析方法。
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# === 0. Conda环境搭建 === conda create -n sc_cellrangeranalysis python=3.10 -y conda activate sc_cellrangeranalysis conda install -c bioconda fastqc multiqc pigz csvtk wget samtools -y # 创建工作目录结构 mkdir -p sc_project/{raw_data/{rna,bcr},ref_genome,software,results,qc_reports,rna_samples/{Control,Self-DNA},bcr_samples/{Control,Self-DNA}} # 建好目录将测序数据文件（包括所有的fastq.gz和md5文件）分别放入`raw_data/rna` # raw_data/bcr`目录中 # === 1. 文件校验 ===使用MD5校验文件完整性。 echo "=== 步骤1/7: 文件校验 ===" # 转录组数据校验 cd sc_project/raw_data/rna md5sum -c *.md5 > ../../qc_reports/rna_md5.log 2>&1 # BCR数据校验 cd ../bcr md5sum -c *.md5 > ../../qc_reports/bcr_md5.log 2>&1 # 检查校验结果 if grep -q &#39;FAILED&#39; ../qc_reports/*_md5.log; then echo "❌ 文件校验失败！请检查日志：" grep &#39;FAILED&#39; ../qc_reports/*_md5.log exit 1 else echo "✅ 所有文件校验通过" fi # === 2. 原始数据质控 ===使用FastQC进行原始数据质量检查。 echo "=== 步骤2/7: 原始数据质控 ===" cd ../../qc_reports # 转录组质控 fastqc ../raw_data/rna/*.fastq.gz -t 12 -o rna_fastqc # 使用12线程 multiqc rna_fastqc -n rna_multiqc_report # BCR质控 fastqc ../raw_data/bcr/*.fastq.gz -t 12 -o bcr_fastqc multiqc bcr_fastqc -n bcr_multiqc_report echo "质控报告生成：" echo "转录组：sc_project/qc_reports/rna_multiqc_report.html" echo "BCR：sc_project/qc_reports/bcr_multiqc_report.html" # === 3. 文件组织 === echo "=== 步骤3/7: 文件组织 ===" cd .. # 转录组文件整理 mv raw_data/rna/Control_S87_L004_R1_001.fastq.gz rna_samples/Control/ mv raw_data/rna/Control_S87_L004_R2_001.fastq.gz rna_samples/Control/ mv raw_data/rna/Self-DNA_S86_L004_R1_001.fastq.gz rna_samples/Self-DNA/ mv raw_data/rna/Self-DNA_S86_L004_R2_001.fastq.gz rna_samples/Self-DNA/ # BCR文件整理 mv raw_data/bcr/Control_S113_L008_R1_001.fastq.gz bcr_samples/Control/ mv raw_data/bcr/Control_S113_L008_R2_001.fastq.gz bcr_samples/Control/ mv raw_data/bcr/Self-DNA_S113_L008_R1_001.fastq.gz bcr_samples/Self-DNA/ mv raw_data/bcr/Self-DNA_S113_L008_R2_001.fastq.gz bcr_samples/Self-DNA/ # 简化文件名（适配Cell Ranger） rename &#39;s/_S\d+_L00[48]_//&#39; rna_samples/*/*.fastq.gz rename &#39;s/_S\d+_L00[48]_//&#39; bcr_samples/*/*.fastq.gz # === 4. 下载安装Cell Ranger 9.0.1 === echo "=== 步骤4/7: 安装Cell Ranger 9.0.1 ===" cd software # 下载最新版Cell Ranger (tar.xz格式更小) wget -O cellranger-9.0.1.tar.xz "https://cf.10xgenomics.com/releases/cell-exp/cellranger-9.0.1.tar.xz" # 校验文件完整性 echo "540fe4256c8d12d7f701303983ed3d48 cellranger-9.0.1.tar.xz" | md5sum -c # 解压安装 tar -xvf cellranger-9.0.1.tar.xz export PATH=$(pwd)/cellranger-9.0.1:$PATH # 验证安装 cellranger --version # === 5. 下载参考基因组 === echo "=== 步骤5/7: 下载参考基因组 ===" cd ../ref_genome # 1. 转录组参考基因组（小鼠GRCm39最新版） wget "https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-exp/refdata-gex-GRCm39-2024-A.tar.gz" echo "37c51137ccaeabd4d151f80dc86ce0b3 refdata-gex-GRCm39-2024-A.tar.gz" | md5sum -c tar -xzf refdata-gex-GRCm39-2024-A.tar.gz # 2. BCR参考基因组（使用官方GRCm38版本） wget "https://cf.10xgenomics.com/supp/cell-vdj/refdata-cellranger-vdj-GRCm38-alts-ensembl-7.0.0.tar.gz" echo "c6f41db8f67aa83b04d64ba1ae96e681 refdata-cellranger-vdj-GRCm38-alts-ensembl-7.0.0.tar.gz" | md5sum -c tar -xzf refdata-cellranger-vdj-GRCm38-alts-ensembl-7.0.0.tar.gz # 3. 创建兼容链接（解决版本不匹配问题） ln -s refdata-cellranger-vdj-GRCm38-alts-ensembl-7.0.0 refdata-cellranger-vdj-GRCm39-2024-A echo "✅ 创建兼容链接：GRCm38 -> GRCm39" # === 6. 运行Cell Ranger整合分析 === echo "=== 步骤6/7: 运行Cell Ranger整合分析 ===" cd ../results # 创建配置文件 cat > multi_config.csv <<CFG_EOF [gene-expression] reference = ../ref_genome/refdata-gex-GRCm39-2024-A chemistry = auto include-introns = true # 开启内含子（需要RNA速率分析） # 关闭内含子（include-introns = false） [vdj] reference = ../ref_genome/refdata-cellranger-vdj-GRCm39-2024-A # 使用兼容链接 include-introns = false # BCR必须关闭内含子（防止假阳性结果） [samples] rna_Control,vdj_Control rna_Self-DNA,vdj_Self-DNA [rna_Control] fastq_path = ../rna_samples/Control sample = Control [vdj_Control] fastq_path = ../bcr_samples/Control sample = Control [rna_Self-DNA] fastq_path = ../rna_samples/Self-DNA sample = Self-DNA [vdj_Self-DNA] fastq_path = ../bcr_samples/Self-DNA sample = Self-DNA CFG_EOF # 针对i7-12700KF + 64GB RAM优化参数（运行整合分析） echo "启动整合分析（预计4-8小时）..." cellranger multi \ --id=combined_results \ --csv=multi_config.csv \ --expect-cells=10000 \ --localcores=16 \ # 使用16线程（12物理核心+超线程） --localmem=58 \ # 分配52GB内存（保留12GB给系统） --mempercore=4.8 \ # 每核心3GB内存(16×3=48GB) --disable-ui \ # 关闭GUI节省资源 --maxjobs=3 \ # 控制并行任务数防止OO,防止内存溢出 --nosecondary # 跳过耗内存的二级分析 echo "✅ 分析完成！结果保存在: sc_project/results/combined_results" # === 7. 结果解读 === echo "=== 步骤7/7: 结果解读 ===" # 生成总结报告 multiqc combined_results/outs/ -n final_report # 关键结果路径 echo "" echo "================ 分析结果 ================" echo "1. 整合报告: sc_project/results/final_report.html" echo "2. Control转录组: sc_project/results/combined_results/outs/per_sample_outs/Control/count/web_summary.html" echo "3. Control BCR: sc_project/results/combined_results/outs/per_sample_outs/Control/vdj_t/vdj_control.web_summary.html" echo "4. Self-DNA转录组: sc_project/results/combined_results/outs/per_sample_outs/Self-DNA/count/web_summary.html" echo "5. Self-DNA BCR: sc_project/results/combined_results/outs/per_sample_outs/Self-DNA/vdj_t/vdj_control.web_summary.html" echo "" echo "================ 关键指标 ================" echo "转录组质量:" grep "Median Genes per Cell" combined_results/outs/per_sample_outs/*/count/web_summary.html echo "" echo "BCR质量:" grep "Cells with Productive V-J Spanning Pair" combined_results/outs/per_sample_outs/*/vdj_t/vdj_control.web_summary.html echo "==========================================" # 后续分析准备 echo "后续分析建议:" echo "1. 使用Loupe Browser打开.cloupe文件" echo "2. 克隆型分析: combined_results/outs/per_sample_outs/*/vdj_t/clonotypes.csv" echo "3. 基因表达矩阵: combined_results/outs/per_sample_outs/*/count/filtered_feature_bc_matrix.h5" EOF以上cellranger步骤是否可行、
06-26
- **格式要求**：支持标准FASTQ文件（需符合Illumina测序平台命名规范）[^1] - **样本配置**：需提供CSV格式的样本清单文件，包含： ```csv [libraries] fastq_id,fastqs,feature_types sample1,/path/to/fastq,...
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