通过blast结果选择完全overlap的序列

最新推荐文章于 2025-03-16 16:41:01 发布

msw521sg

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分类专栏：生物信息 python 文章标签：基因组-生物信息学 python

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/msw521sg/article/details/52562308

该博客介绍了如何基于blast分析结果，挑选出那些在序列上完全重叠的部分，而不关注identity的比例。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

根据blast结果选择完全overlap的序列，此时没有考虑identity的高低

Query	Target	overlap_length	identity	Query_length	Target_length	Percent	Q_start	Q_end	T_start	T_end	strand
UN065663	maker-lcl|TGACv1_scaffold_643943_U_UN149109-augustus-gene-0.4-mRNA-1	225	97.8%	697	225	32.3%	285	566	0	225	-
UN065663	maker-lcl|TGACv1_scaffold_643943_U_UN133597-augustus-gene-0.4-mRNA-1	225	97.8%	697	225	32.3%	285	566	0	225	-
UN065663	maker-lcl|TGACv1_scaffold_643943_U_UN130225-augustus-gene-0.4-mRNA-1	225	97.8%	697	225	32.3%	285	566	0