基于MPI的Linux计算集群搭建

本文详细介绍了如何在CentOS 7系统上配置MPI计算集群,包括MPICH的安装和MPI4PY的Python接口安装。通过两台计算机构建小型集群,涉及SSH无密码登录、防火墙配置、编译安装MPICH以及MPI4PY的使用测试。

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序言

MPI(Message Passing Interface)是一种较为底层(相比于Spark等)的分布式计算框架,详情可参见Wikipedia上的介绍:
https://en.wikipedia.org/wiki/Message_Passing_Interface
本文将对MPI在CentOS 7系统上的编译配置,以及相应的Python接口的安装过程进行介绍。我们基于两台位于同一局域网内的计算机进行配置,将其构成一个小型的计算集群。假设两台计算机的IP地址分别为192.168.100.0和192.168.100.1,都有一个名为mpi的用户。下文中的命令均是在192.168.100.0上执行的,192.168.100.1上的配置命令类似,仅少数涉及IP地址的地方,稍作修改即可。

前期准备工作

CentOS中很多软件需要从EPEL软件源中获取,该软件源的安装方式为:

sudo yum install epel-release*

接下来我们需要配置两台计算机之间的SSH无密码登陆,即基于~/.ssh目录下的authorized_keys文件进行验证。首先,生成各自的公钥文件(有提示输入的时候直接回车确认即可):

ssh-keygen -t rsa
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