蛋白质数据分析与烧伤图像识别的机器学习应用
1. 蛋白质数据分析
1.1 科尔莫戈罗夫 - 斯米尔诺夫检验
对布加综合征(BrS)蛋白(36 种蛋白)和 BrS 突变蛋白(4388 种蛋白)应用了科尔莫戈罗夫 - 斯米尔诺夫双侧检验(α = 0.01),统计 PIM 系统产生的匹配和拒绝数量。相关的 Excel 文件和科尔莫戈罗夫 - 斯米尔诺夫检验可在补充材料部分找到。
1.2 测试计划
1.2.1 极性轮廓
PIM 系统实施两个程序来表征与 BrS 相关的突变蛋白:
- 记录相似度数量以识别 BrS 蛋白组,并与其他组进行比较。例如,若 PIM 系统用独特的 BrS 突变蛋白校准,就用独特的 BrS 蛋白组、抗菌蛋白、无序蛋白和脂蛋白进行测试。
- 比较与 BrS 相关的独特蛋白和突变蛋白的“极性轮廓”。获取代表独特的与 BrS 相关的突变蛋白的“极性轮廓”,并以此信息在 UniProt 数据库中查找与所有已审查蛋白生成的“极性轮廓”的重合情况。
1.2.2 抗菌肽
| # | 数量 | 组 |
|---|---|---|
| 1 | 21 | SCAAP |
| 2 | 469 | 细菌 |
| 3 | 86 |
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