A Fixed-Point Model for Pancreas Segmentation in Abdominal CT Scans

本文介绍了一种固定点模型在腹部CT扫描中胰腺分割的应用,通过预测的分割结果收缩输入区域,引入转换函数并优化模型。训练阶段采用金标准Y输入,分为coarse和fine两组模型,利用数据增强策略防止过拟合。测试阶段采用迭代过程寻找稳定解,最终实现高精度的胰腺分割。

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翻译文章:A Fixed-Point Model for Pancreas Segmentation in Abdominal CT Scans

 

Fixed-Point Optimization

利用预测的分割结果来收缩输入区域。引入了一个转换函数,根据给定的分割结果产生输入区域。重新定义模型为:,损失函数是:,因为分割结果在输入与输出中都出现。因此是一个不动点模型。应用该文章中提出的方法优化模型,为Z找到一个稳定的解。

 

在训练阶段,金标准Y作为输入的分割结果,训练两组模型(每组包括不同视图的3个模型),来处理不同的输入大小。coarse-scaled models在pancreas至少占据100个像素的切片上训练,来阻止模型被背景严重影响。fine-scaled models,根据最小的2Dpancreas包围盒来裁剪每张切片,在他的周围添加边框,用原始图像数据来填充它。框架的上下左右边缘是采样于的随机整数。这个策略,作为数据增强,帮助regularize网络并且防止过拟合。

 

我们用在pascal voc segmentation task上预训练的FCN-8s模型来初始化所有网络,coarse-coarse-scaled model通过80000次学习率为10^-5的迭代来fine-tuned,fine-scaled model经理了学习率为10^-4的6000次迭代。每个mini-batch包含一个训练样本。

 

在测试阶段,我们使用一个迭代式的过程来为寻找一个稳定解。开始的时候,用整个volume来初始化,然后计算coarse segmentation 通过使用coarse-scaled models。在接下来的T步接待中的每一步,我们切割预测结果,在每张切片中寻找最小的能覆盖所有预测的前景像素的2D包围盒,在它周围添加30像素宽度的边框((this is the mean value of the random distribution used in training),使用fine-scaled models来计算。迭代终止当给定的迭代次数T达到的时候,或者连续的分割结果的相似性大于给定的阈值R。相似性被定义为迭代间DSC,测试阶段如下图所示:

算法描述如下: 

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