病理图像预处理全流程

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于 2025-08-04 15:34:16 首次发布

1 整体流程

对于病理AI方向来讲，最开始的数据预处理阶段是很难度过的。

SVS和TIFF是病理图像中最常用的两种格式，它们能够有效地存储和处理高分辨率的病理图像数据。DICOM格式因其标准化和互操作性，在医学影像领域得到广泛应用，包括病理图像的存储和传输。

为了有效处理这些大型图像，图像平铺（tiling）和缩放金字塔（pyramid）技术被广泛应用。平铺技术涉及将大图像分割成小块（tile），每块通常为256x256像素。这样，只有当前需要显示或处理的图像块会被加载到内存中，而不是整个图像，这大大减少了内存的使用并提高了处理效率。
缩放金字塔技术则是在图像的原始分辨率基础上创建多个分辨率逐渐降低的副本，形成一个金字塔结构。这些副本可以按照2的幂次（例如，1/2，1/4，1/8，1/16原图尺寸）进行下采样。在图像处理或分析时，可以根据需要选择适当的分辨率级别，从而在不同的尺度上进行操作，这在进行图像特征提取或模式识别时非常有用。
尽管TIFF格式本身不强制要求图像必须是平铺或金字塔结构，但在病理图像分析中，某些库如OpenSlide要求TIFF图像必须是平铺的，以便能够正确读取和处理。如果一个TIFF图像没有按照这些要求进行配置，OpenSlide可能会报告格式不支持的错误。因此，为了确保与这些工具的兼容性，病理图像的TIFF格式通常需要进行特定的预处理，以满足平铺和金字塔结构的要求。对于tiff以及平铺和金字塔技术在文章3中有详细介绍。