freesurfer | 共享库安装/链接问题:error while loading shared libraries: libquadmath.so.0

当系统报错找不到共享库如libquadmath.so.0时,可以检查其是否存在并确认路径。如果存在但系统找不到,可能需要更新共享库配置,例如使用ldconfig或编辑/etc/ld.so.conf。若库不在标准路径下,可以通过设置LD_LIBRARY_PATH环境变量。如果库不存在,则需安装,可以使用yum或手动下载rpm包。遇到yum安装问题,可能需要更换源。

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该方案能解决大部分共享库安装问题

首先检查库的文件是不是真的存在,libquadmath.so.0

locate libquadmath.so.0

(没有locate就按照报错提示安装 sudo apt-get xxx)

1.如果真的存在,像我下面这样报告了位置,那么则是因为系统链接库时路径不对

/snap/gnome-3-38-2004/119/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0
/snap/gnome-3-38-2004/119/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0.0.0
/snap/gnome-3-38-2004/140/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0
/snap/gnome-3-38-2004/140/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0.0.0
/snap/gnome-42-2204/111/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0
/snap/gnome-42-2204/111/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0.0.0
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0
/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libquadmath.so.0.0.0

这样说明执行调用共享库时,系统按照默认共享库路径找不到共享库文件

所以需要修改系统的共享路径的设置

1)如果共享库在/lib或者/usr/lib下,那么执行一下ldconfig命令即可

2)如果共享库安装到了/usr/local/lib很多开源共享库都会安装到该目录下,或者其他目录下,

那么先把新共享库目录加入到共享库配置文件 /etc/ld.so.conf 中

再执行ldconfig

参考下面这篇文章来修改共享库配置文件:

error while loading shared libraries: libopencv_highgui.so.3.4: cannot open shared object file解决方法_Keeling1720的博客-优快云博客

3)如果共享文件安装到其他非lib或者非usr/lib目录下,并且不想在配置文件中加路径或没有权限加路径,那么就export一个全局变量

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/xxxx

这样每次运行程序的时候就会去这个目录中找共享库,可以设置多个搜索目录,冒号隔开

比如安装了一个mysql在/usr/local/mysql目录下,其中一大堆库文件在/usr/local/mysql/lib下面,那么可以在.bashrc或者.bash_profile或者shell里面加入以下语句

export LD_LIBRARY_PATH=/usr/local/mysql/lib:$LD_LIBRARY_PATH

但这只是临时方案,适用于没有权限时

2.如果这个库本身不存在,那么就需要安装 

参考这个

解决软件启动报error while loading shared libraries: libgd.so.2: cannot open shared object错误

一般用yum install xxx,如果yum搜索不到对应包,就需要你手动下载对应rpm包

建议直接网上搜索你的包名字+系统版本,一般会有很多包安装的教程

如果yum命令安装有问题,参考下面这个

yum命令安装出错,可能由于镜像源,需要换源,过程中记得备份source.list再更新换源

Ubuntu22.04 解决 E: 无法定位软件包 yum_qq_44807154的博客-优快云博客

### 解决FreeSurfer ML例程错误的方法 当遇到FreeSurfer中的机器学习(ML)例程出现问题时,通常是因为环境配置不正确或依赖项缺失。以下是详细的解决方案: #### 环境变量设置不当 确保所有必要的环境变量已正确定义并指向正确的路径。对于FreeSurfer来说,这包括但不限于`FREESURFER_HOME`, `SUBJECTS_DIR`等重要目录的位置设定[^1]。 ```bash export FREESURFER_HOME=/path/to/freesurfer source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh ``` #### 缺失的依赖库 某些情况下,特定版本的操作系统可能缺少运行这些工具所需的共享库文件。如果发现类似`error while loading shared libraries: libquadmath.so.0`这样的报错信息,则表明存在未满足的软件包需求[^4]。 可以通过执行如下命令来安装缺失的库: ```bash sudo apt-get update && sudo apt-get install -y libquadmath0 ``` #### Python解释器及其模块冲突 由于部分ML脚本可能是基于Python编写的,在不同版本之间切换可能会引发兼容性问题。确认使用的Python版本以及相关科学计算库如NumPy、SciPy是否匹配当前程序的要求。 另外还需注意MATLAB集成情况下的启动文件位置验证,确保其路径有效且内容无误: ```matlab if ~exist(fullfile(getenv('HOME'), 'matlab', 'startup.m'), 'file') % 创建默认启动文件... end ``` #### 数据集准备不足 输入数据格式不符合预期也会造成处理失败。参照官方文档说明检查所给定的数据结构是否遵循标准命名约定;特别是关于左半球(`lh`)和右半球(`rh`)标记的部分应特别留意准确性[^2]。 通过以上几个方面的排查可以有效地定位并修复大多数由外部因素引起的ML功能异常现象。当然具体到每一个实例还需要结合实际情况灵活应对。
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