皎皎如月明-优快云博客

原创 BCT计算图论属性

本文翻译了BCT官网给出的一些指导，同时包含本人在计算图论属性过程中的一些思考目前看到的教程中，大部分都只用一个确定的稀疏度来计算图论属性我更倾向于gretna那种采用稀疏度序列来计算AUC曲线下面积衡量不同稀疏度下组间差异的方法大部分图论属性都与网络稀疏度取值相关，只用一个稀疏度得到的指标在我看来是不够可靠的。

2025-02-25 16:09:45 984

原创纤维束追踪效果评估 checklist

一些基于解剖学经验的纤维束追踪效果checklist，帮助比较不同追踪参数（例如）对不同脑区之间纤维束形状、密度、长度和分布的影响本checklist基于纤维密度图进行视觉检查，适用于不确定追踪结果是否正确或者想要比较不同参数追踪效果的研究者。

2024-12-30 09:22:13 805

原创 MRtrix3安装报错2则：Checking for Qt: ERROR: error linking Qt application!

于是去github看了一下，发现很多人在提这个bug，现在还没有一个ubuntu下很好的解决方案（果断放弃）于是我选择源码编译的方法重新安装MRtrix3，但是官网目前找不到了，还好旧教程还在。查了一下，应该是安装的fsl和conda的包之间有冲突了，conda选择了冻结。反正很难解决，我换源，加channel什么的都试了，都没办法解决，我还是太菜了。当时看到一篇博文遇到一样的问题，可是怎么解决说的语焉不详，试了一下直接终端。参考这个步骤，如果你很顺畅的跑下来了，那么祝贺你下面不用看了。

2023-12-22 17:10:28 751 2

原创 ANTs安装报错：ccmake NIFTI_SYSTEM_MATH_LIB (ADVANCED)相关[CMakeFiles/Makefile2:105：CMakeFiles/ITKv5.解决方法

中间编译的时候我没有SuperBuild_ANTS_USE_GIT_PROTOCOL选项，一开始有点慌，但是作者说这个是与github有关的，我想了下我的网还挺稳定的不担心编译失败就没管（没有的朋友可以按t然后向下找一下，我是真没有，有的纯粹是放后面了）直到我看到一个资料上说ccmake版本更新问题导致他编译报错，联想到我以前安装ANTs并没有出这个问题，因为我以前ccmake是直接指令下载版本都很旧，这次则是被某教程误导去网站上下载了最新的ccmake，故我开始怀疑是版本问题（大坑！

2023-10-23 20:29:46 253 3

原创 freesurfer | 共享库安装/链接问题：error while loading shared libraries: libquadmath.so.0

该方案能解决大部分共享库安装问题。首先检查库的文件是不是真的存在，libquadmath.so.0（没有locate就按照报错提示安装 sudo apt-get xxx）

2023-06-21 15:17:19 698

原创 Randomise跑统计分析报错：ERROR: Program faileddesign.mat is not a valid vest file

查了一下，发现问题在于自己写的design.mat文本和design.con文本并没有被randomise识别。design matrix和contrast都按照randomise官网要求设置，但还是报错。把自己的文本名设为 design.txt，然后转格式。做完TBSS用randomis跑统计分析。contrast同理。

2023-03-27 20:40:25 403 6

原创 Gretna计算网络指标操作

gretna计算网络属性

2023-03-10 10:30:30 6265 20

原创一张图带你看完图论第八章（包含全部考点，含定义、定理、公式、推导证明和所有例题）

包含第八章所有考点，没写就是不考~

2023-03-02 10:40:24 289

原创一张图带你看完图论第七章（包含全部考点，含定义、定理、公式、推导证明和所有例题）

包含第七章所有考点，没写就是不考~

2023-03-02 10:35:47 576

原创一张图带你看完图论第六章（包含全部考点，含定义、定理、公式、推导证明和所有例题）

包含第六章全部考点，没写就是不考~

2023-03-02 10:34:32 587

原创一张图带你看完图论第五章（包含全部考点，含定义、定理、公式、推导证明和所有例题）

包含第五章全部考点，没写就是不考~

2023-03-02 10:31:10 955

原创一张图带你看完图论第四章（包含全部考点，含定义、定理、公式、推导证明和所有例题）

包含第四章所有考点，没提到的就是不考~~

2023-02-28 21:51:40 701

原创虚拟机扩展根目录下空间+cp: 无法创建符号链接

调整时只能对相邻磁盘扩容，所以未分配空间与根目录磁盘之间如果有其他磁盘，需要先删除再复原，具体细节见开头链接。①关闭虚拟机（关之前先删点东西，确保图形界面能打开，或者cp到共享文档再删）然后打开调整你根目录所在磁盘的空间就行，调整完点勾勾再重启就ok了。原因是windows系统与linux系统符号链接之间出现冲突。编辑扩展磁盘空间（有快照要先删除才能扩展）②打开虚拟机下载gparted。2.cp: 无法创建符号链接。1.虚拟机扩展根目录空间。

2022-11-28 11:32:17 1009

原创 ubuntu20.04 报错：This application failed to start because no Qt platform plugin could be initialized.

我是在用freeview的时候出现这个问题，freesurfer正常但是freeview打不开。查了一下是因为freeview中调用的python依赖qt，但是qt没装好。2.再运行freeview，这个时候会详细报告缺少哪些库。1.先sudo gedit ~/.bashrc。其他类似的依赖于qt的命令也可以参考这个。然后保存，source一下配置文件。3.再freeview就可以打开了。打开配置文件，在后面加一行。

2022-09-11 21:07:30 4857 4

原创 Fixel-based analysis步骤翻译+实战-计算纤维束密度、纤维束横截面积

纤维束微观结构分析

2022-08-10 19:40:57 318

原创 freesurfer | 报错：转移处理结果的文件夹到共享文件夹cp: cannot create symbolic link XXX Operation not permitted

参考来自：cp: cannot create symbolic link XXX Operation not permitted_light1028的博客-优快云博客1.没有权限此处已经保证包括的源和目的地，都是由权限操作的，排除此原因。2.目标文件系统不支持符号链接即，源文件夹是 /usr/src/blackfin/ADI_release/kernel/2007R1/carifan_Bfin_425,属于/目录下面，对应的是ext3,因此本身是支持符号链接的，而目标文件夹是 /mnt/linuxdev/

2022-06-14 17:17:26 569

mingrisanyang的博客