Lammps2020版基于Intel 2019 编译器安装

LAMMPS简介

LAMMPS由美国Sandia国家实验室开发，以GPL license发布，即开放源代码且可以免费获取使用，这意味着使用者可以根据自己的需要自行修改源代码。LAMMPS可以支持包括气态，液态或者固态相形态下、各种系综下、百万级的原子分子体系，并提供支持多种势函数，并且LAMMPS有良好的并行扩展性，适合大型HPC集群下的并行运行。

安装环境需求

系统：Centos7
所需软件包：lammps-stable.tar.gz
parallel_studio_xe_2019_update4_cluster_edition.tgz

软件安装步骤

编译环境设置
我们使用intel编译器编译lammps，使用intel MPI运行lammps

下载安装包

cp lammps-stable.tar.gz /opt/software

解压

tar xvf lammps-stable.tar.gz

得到lammps的目录

/opt/software/lammps10Oct20/

进入lammps安装目录

cd /opt/software/lammps10Oct20/src

查看所有package

make package-status

选择需要安装的package比如

make yes-peri

make yes-manybody

由于2020版Lammps的编写是用老版本的C++11的std空间，在编译时会报错，所以需要修改编译器版本，如果下载的编译文件std的参数有c++11则跳到下一步。

vi /opt/software/lammps10Oct20/src/MAKE/OPTIONS/intel_cpu_intelmpi
-std=c++11

编译

make -j 10 intel_cpu_intelmpi

测试

从examples里复制一个lammps算例文件测试到用户家目录里并改成lammps_test目录

cp -r /opt/software/lammps-10Oct20/examples/shear ~/lammps_test

进入测试目录

cd ~/lammps_test

mpirun -np 20 / opt/software /lammps10Otc20/src/lmp_intel_cpu_intelmpi < in.shear