生物医学信息学:机器学习助力个性化医疗
1. 药效团识别
1.1 抗铜绿假单胞菌分子的药效团
对于一个分子 M 若要对铜绿假单胞菌有活性,需满足在构象 B 下的以下条件:
- M 具有疏水基团 C;
- M 具有氢受体 D,且在构象 B 下 C 和 D 的距离为 11.7 Å,公差为 1.5 Å;
- M 具有带正电的原子 E,在构象 B 下 C 和 E 的距离为 4 Å,D 和 E 的距离为 9.4 Å;
- M 具有带正电的原子 F,在构象 B 下 C 和 F 的距离为 11.1 Å,D 和 F 的距离为 12.6 Å,E 和 F 的距离为 8.7 Å。
1.2 多巴胺激动剂的药效团
分子 A 具有所需活性需满足在构象 B 下的以下条件:
- 在 C 处含有氢受体;
- 在 D 处含有碱性氮基团,C 和 D 的距离为 7.05966 ± 0.75 Å;
- 在 E 处含有氢受体,C 和 E 的距离为 2.80871 ± 0.75 Å,D 和 E 的距离为 6.36846 ± 0.75 Å;
- 在 F 处含有疏水基团,C 和 F 的距离为 2.68136 ± 0.75 Å,D 和 F 的距离为 4.80399 ± 0.75 Å,E 和 F 的距离为 2.74602 ± 0.75 Å。
2. 电子病历与个性化医疗
2.1 预测性个性化医疗(PPM)的愿景
PPM 是未来医疗的愿景,医生可以为每个患者制定更安全、更有效的预防和治疗计划。这通过预测治疗对患者的影响来实现,包括对不同类型患者的有效性、某些药物的不良反应以及不同类型患者
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