<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?><rss version="2.0"><channel><title><![CDATA[makoudada的博客]]></title><description><![CDATA[]]></description><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada</link><language>zh-cn</language><generator>https://blog.youkuaiyun.com/</generator><copyright><![CDATA[Copyright &copy; makoudada]]></copyright><item><title><![CDATA[Mac电脑画图报错 load failed for “Cairo‘:.onLoad failed in loadNamespace()]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/136938974</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/136938974</guid><author>makoudada</author><pubDate>Fri, 22 Mar 2024 13:55:31 +0800</pubDate><description><![CDATA[我是用 Mac 电脑 R 画图，需要用到 Cairo 包，但是我尝试多次都是报如下的错误。可能是 Mac 电脑需要另外下载一个软件。我最后是用别人的电脑跑成功的。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[GEO 数据库 GPL5188 平台的基因注释信息]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/132377718</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/132377718</guid><author>makoudada</author><pubDate>Sat, 19 Aug 2023 11:22:13 +0800</pubDate><description><![CDATA[不过只有 soft 文件，基因名在用 // 符号分割 的gene assignment 列。但是用来注释发现探针和注释包的 ID 并不一致。所以记录一下，这个数据最后也没注释成功。#GEO 数据库 GPL5188 平台的基因注释信息。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[MAC 苹果电脑加载 GSVA 包报错，链接不上共享软件库sparseMatrixStats.so]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/130398573</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/130398573</guid><author>makoudada</author><pubDate>Thu, 27 Apr 2023 08:52:15 +0800</pubDate><description><![CDATA[【代码】【无标题】]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[GPL11154平台缺少基因注释信息]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/128949957</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/128949957</guid><author>makoudada</author><pubDate>Thu, 09 Feb 2023 11:29:45 +0800</pubDate><description><![CDATA[GPL11154平台缺少基因注释信息]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[＜文献阅读＞用转移熵通过微阵列的时间序列推断基因调控网络(inferring gene regulatory networks from microarray time series data]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/117467630</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/117467630</guid><author>makoudada</author><pubDate>Wed, 02 Jun 2021 14:33:31 +0800</pubDate><description><![CDATA[这篇文章是2007的时候发表在IEEE杂志上，并没有收录到PubMed里面。是韩国的学者开发出来的方法。具体来说，通过转移熵计算基因对的因果关系(causal relations), 也就是转移熵的值。转移熵不是负数，而且大小代表因果关系的强度。
##题目：Inferring gene regulatory networks from microarray time series data using transfer entropy
##引入
衡量两个变量的关系可以用相关系数、互相关、互信息。但是这些是对]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[r语言安装r包]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/111484744</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/111484744</guid><author>makoudada</author><pubDate>Mon, 21 Dec 2020 20:03:20 +0800</pubDate><description><![CDATA[r语言安装r包2020首先根据r包存储的地方，就可以分为三种下载方式CRANbioconductorGitHub其他安装方式
首先根据r包存储的地方，就可以分为三种下载方式
cran，bioconductor还有GitHub。bioconductor一般都是生物信息方面的R包。github是代码的托管平台，很多软件，多种语言的程序包也都在这里发布。
CRAN
// CRAN里的r包下载代码
install.packages("dyplr")

注意

这种方法只能够下载cran里的r包，如果r包在githu]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[原文件内容更新及备份，特殊标量$^I和@ARGV学习笔记]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/104283462</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/104283462</guid><author>makoudada</author><pubDate>Wed, 12 Feb 2020 19:54:29 +0800</pubDate><description><![CDATA[#!/usr/bin/perl
use strict;
use warnings;
my $filename="C:\\Users\\Chen\\abv.txt";
$^I= ".bak";
push @ARGV,$filename;
while(&lt;&gt;){
       s/haha/h/g;
       print;}

&lt;&gt;钻石操作符会调用@ARGV数组（由命令行参数...]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[技嘉G31主板学习笔记]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/104201884</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/104201884</guid><author>makoudada</author><pubDate>Thu, 06 Feb 2020 21:14:06 +0800</pubDate><description><![CDATA[中间黄铜色的印有GIGABYTE就是集成显卡。右边是cpu，摁下cpu左侧的杆，就可以打开cpu的盖子，拿下cpu。这个是技嘉G31主板，LGA775针的cpu。
黄色长条的就是内存条，此主板是ddr2，最多两个内存条4G内存。
依次向下，就是绿色的DVD盒与主板的线插口，与白色主板电源插口。
再向左就是开机键、重启键与它们的指示灯的电源插口。
再向左就是硬盘线的插口。
向上，就是机箱前面的us...]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[拆卸台式电脑主机，cpu，硬盘，内存条等]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/104199180</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/104199180</guid><author>makoudada</author><pubDate>Thu, 06 Feb 2020 17:55:06 +0800</pubDate><description><![CDATA[写在前面：
家里有台九年的电脑，window xp系统，已经开不了机了。想升级下系统和硬件设施。所以先拆下来看看。
1.
从上至下，从左至右，依次是电源、DVD、主板、硬盘。
2电源

**电源内部


3.DVD


...]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[安装Rtools的问题]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/103445418</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/103445418</guid><author>makoudada</author><pubDate>Sun, 08 Dec 2019 15:39:05 +0800</pubDate><description><![CDATA[用rstudio直接键入命令
library（installr）
install.Rtools（）
直接安装Rtools
设置环境变量
Sys.getenv（“PATH”）
#查看当前环境变量
path&lt;-c()
path&lt;-paste(,collapse=";")
Sys.setenv(PATH=" ")
#设置环境变量

...]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[下载r包IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/103445306</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/103445306</guid><author>makoudada</author><pubDate>Sun, 08 Dec 2019 15:26:24 +0800</pubDate><description><![CDATA[BiocManager::install(“IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19”)
用此命令下载r包IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19报错
error：loading failed for ‘i386’
记录一下

]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[安装部分bioconductor的r包报错‘i386’]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/103285366</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/makoudada/article/details/103285366</guid><author>makoudada</author><pubDate>Wed, 27 Nov 2019 23:13:37 +0800</pubDate><description><![CDATA[处理ncbi上的甲基化数据，在下载r包时IlluminaHumanMethylation450kmanifest时，显示r与Windows的前后端停止工作。不论是biomanager下载还是压缩包解压都是这样报错。最后通过管之前下好的人要的文件成功做的。

...]]></description><category></category></item></channel></rss>