下载r包IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19

最新推荐文章于 2024-07-23 10:11:11 发布
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#R #IlluminaHumanMethylation450kanno.il

本文记录了一次使用BiocManager安装R包IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19时遇到的错误：加载失败于'i386'。该文将探讨可能的原因及解决方案。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

BiocManager::install(“IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19”)
用此命令下载r包IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19报错
error：loading failed for ‘i386’
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makoudada
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安装一个不存在的R包
weixin_44493991的博客
03-03 507
<生信交流与合作请关注公众号@生信探索> 需要用到DNA甲基化芯片的注释包IlluminaHumanMethylation450k.db，但是用BiocManager安装会报错“is not available”. 搜到了生信技能树的文章《如果这个R包真的不存在了肿么办》，但只谈到包被删除了之前是存在的... https://cloud.tencent.com/developer/article/1508953 也就是说，这个包是被删除了，在 https://bioconductor.org/a
数据分析：甲基化分析-从DNA methylation的IDAT文件到CpG site的Beta values
专注生信领域
04-26 1621
甲基化分析，从IDAT文件到Beta values
GEO表达芯片平台 — GPL14951，注释文件探索过程 geo注释文件 比对 数据比对 对比 探针基因名转换 gpl
生信小博士的博客
09-28 5391
的确这个平台无法找到！
为啥我安装R包总出现‘...had non-zero exit status.‘？？
qq_41596063的博客
09-06 3万+
安装R包时总出现'...had non-zero exit status.'，这次终于解决了！！！下次再遇到，就按这个思路解决！！
illuminaro:使用 Python 构建交互式 Web 应用程序
07-08
光明会 Illuminaro 是一个用于使用 Python 构建交互式富 Web 应用程序的包。 Illuminaro 你好世界 安装 illuminaro 后，将以下代码保存到 hello_illuminaro.py 从 illuminaro 进口 * gui = 简单页面( '第一个 Illuminaro 应用程序', TextOutput(id='text_output', text='Hello from Illuminaro') ) IlluminaroApp(gui, None).run() 设置PYTHONPATH=. 或PYTHONPATH=/path/to/illuminaro以便 python 可以找到 illuminaro 代码并使用python examples/hello_illuminaro.py运行它，然后在您的浏览器中导航到您应该看到一个简单的文本
GEO生信数据挖掘（二）下载基因芯片平台文件及注释
zzh1464501547的博客
09-27 1万+
检索到目标数据集后，开始数据挖掘，本文以阿尔兹海默症数据集GSE1297为例上节我们，但是矩阵行名称是芯片探针需要转换为基因名。
DNA甲基化分析流程R语言（从数据下载开始）
最新发布
04-28
这里可能需要解释如何将探针注释到基因，使用如IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19这样的注释包。 可视化部分，用户可能需要热图、火山图、曼哈顿图等。可以推荐使用ggplot2、ComplexHeatmap等包，给出...
r语言tcga甲基化数据处理
04-28
可以使用R中的Bioconductor包（如minfi、IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19等）来处理和分析甲基化数据。 3. 数据质量控制：进行数据质量控制，包括样本质量评估、异常值检测、批次效应校正等。可以...
2019年整理数据分析在企业运营决策中的应用.doc
07-11
如Kanno模型用于新品决策，线性规划解决多产品、多目标问题，而EPQ和EOQ模型则帮助企业制定最佳库存策略。在产能决策中，动态批量模型(Dynamic-Lot Size)有助于企业在资源有限的情况下实现高效生产。 三、数据分析...
总结一些vue3小知识3
kanno的博客
07-23 526
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methylation:用于Illumina甲基化阵列的软件包
04-29
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安装部分bioconductor的r包报错‘i386’
makoudada的博客
11-27 1910
处理ncbi上的甲基化数据，在下载r包时IlluminaHumanMethylation450kmanifest时，显示r与Windows的前后端停止工作。不论是biomanager下载还是压缩包解压都是这样报错。最后通过管之前下好的人要的文件成功做的。 ...
甲基化芯片学习
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CHAMP: 甲基化数据的差异分析 本文介绍如何使用CHAMP包对自己的甲基化数据进行分析(QC, CNV, DMP, DMR等) 包的安装 setwd('E:/wu/R') #~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~# source(&quot;http://bioconductor.org/biocLite.R&quot;) ##if faild, try the follow...
基因组注释文件(GFF,GTF)下载的五种方法
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Baimoc
04-17 7万+
文章目录NCBIEnsemblUCSCGeneCode NCBI Ncbi 里包含现在最全的参考基因组数据，可以进入FTP站点查看：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/ 这里的文件夹名为物种的拉丁名，这里以 Human(Homo_sapiens) 为例，下载方法如下： wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/Homo_sa...
R语言TCGA数据下载及处理biolinks包的学习与使用（一）数据下载
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TCGA数据使用biolinks包处理（一）数据下载
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