Materials Studio学习笔记（十七）——计算Connolly表面

（本文内容与《Materials Studio学习笔记（十二）》内容相连较为紧密）

Connolly表面（康诺利表面）是计算化学和分子生物学中用于描述分子三维表面的一种模型，由科学家Michael Connolly在1980年代提出。它主要用于分析分子的形状、溶剂可及性以及分子间相互作用。

1 计算Connolly表面

本例子是计算沸石的Connolly表面。在沸石结构中有很多等位面，但是沸石不能直接像苯环那样计算出来，因为苯环是分子结构，不是晶体结构，但是向金属等晶体结构不能直接计算出来。

首先导入MOR的晶胞，点击Materials Studio软件中share文件夹，然后选择Structure，然后选择zeolites，最后选择MOR晶胞：

首先点击Tools选项栏中的Atom Volumes&Surfaces：

进入下面的界面：

正常固体是选择Gonoolly surface，Grid resolution选择Coarse、Medium、fine、Ultra-fine，这里先选择Corase，点击Create：

通过放大观察可以看到：

这是比较粗糙情况下进行的计算。

如果将