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原创 colorspace.c:2:10: fatal error: ctype.h: No such file or directory
【代码】colorspace.c:2:10: fatal error: ctype.h: No such file or directory。
2024-03-29 10:05:34
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原创 RNA-seq
表达矩阵:1.芯片2.rna-seqrna seq:bulk vs single cell for heterogenous异质性。
2023-08-21 18:04:04
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原创 三代基因组全基因组的变异检测
本例使用三代组装的玉米NAM群体为例。通过AnchorWave进行全基因组比对,通过gatk进行变异检测。通过tassel进行格式转换。
2023-04-04 16:59:03
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原创 Linux 入门常见命令大全-初学者必看
本文是我在学习linux过程学习到的相关基本命令行。linux系统有两个常见应用界面CentOS和Ubuntu。
2022-08-16 19:19:33
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原创 anchorwave进行复杂基因组比对(3)
anchorwave以玉米B73和Mo17为例对存在倒位的基因组进行全基因组比对。与其他主流软件相比,具有较好的敏感性和准确率。
2022-08-16 15:36:49
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原创 anchorwave进行复杂基因组比对(2)
本文使用anchorwave以两个不同品种的拟南芥为例对不存在全基因组加倍,转座子插入,倒位等染色体变异基因组间进行全基因组比对和变异检测。
2022-08-15 19:39:02
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原创 anchorwave进行复杂基因组比对(1)
anchorwave能够进行敏感且准确的基因组比对。本文以斑马鱼和金鱼为例进行基因组比对,他们之间存在全基因组加倍,染色体重排等,anchorwave表现出较好的比对效果。
2022-08-15 15:00:31
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翻译 基因组比对神器anchorwave的流程
全基因组比对软件anchorwave,它对植物基因组非常敏感和准确,同时也适用于动物和人,能够同时识别短的和长的indel,进行比对时需要设置WGD次数,所以重复序列基本不会错误。
2022-08-15 09:46:33
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空空如也
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