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翻译 水中的溶菌酶 第一步:准备拓扑
【译者注:关于水模型:gromacs自带的有SPC(简单点电荷模型,spc),SPC/E(扩展的简单点电荷模型,spce),TIP3P(三点水模型,tip3p),TIP4P(四点水模型,tip4p),TIP5P(五点水模型,tip5p)。不是万能的,不是所有分子的拓扑都能用它生成,只有力场(在.rtp文件中,通常是蛋白,核酸和一些非常有限的辅因子,如NAD(H)和ATP)中已经定义的残基才能用。是一个GROMACS格式的结构文件,包含所有在力场中定义的原子(例如,H原子已添加到蛋白质的氨基酸残基上)。
2022-11-16 23:55:19
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原创 生物化学部分中英对照(持续更新中)
单糖 monosaccharide二糖 disaccharide寡糖 oligosaccharide多糖 polysaccharide甘油醛 glyceraldehyde非对映体 diastereomer差向异构体 epimer葡萄糖 glucose Glc果糖 fructose Fru半乳糖 galactose Gal 脑糖甘露糖 mannose Man淀粉 starch糖原 glycogen蛋白聚糖 proteoglycan PG
2022-10-22 23:33:06
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原创 PDB文件详解一:标题部分
PDB标题部分内容详解,包含HEADER、TITLE、COMPND、SOURCE、KEYWDS、EXPDTA、AUTHOR、REVDAT、JRNL、REMARK行头解析
2022-09-25 00:08:51
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原创 AutoDock Vina 全套软件安装教程(Linux)
本教程安装的软件包括:AutoDock Vina、ADFR suite、LePro、Visual Studio Code、PyMOL
2022-09-12 21:13:33
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原创 LeDock系列分子对接软件使用方法【Usage】记录一:LeDock
LeDock命令详解Windows版本的LeDock与LePro合并,无LeFrag、LeWater和其他附加模块,将作单独一讲。
2022-07-14 11:59:08
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原创 关于小容量固态硬盘可分区大小远小于实际可用空间的解决方案
问题情况:256G固态硬盘,可用空间100G,可分区空间不足10000MB解决方案:备份电脑,重装系统时选择格式化当初是为了装linux才想去给硬盘分区,一看可分区空间才10000MB人都傻了。这分个啥?遂上优快云寻找解决方案,无果。有各种操作的,解除各种系统限制的,优化存储的,等等等等,其实没多大用,至少对我来说是这样,一顿操作完多出的可分区空间还不到5GB。来说说我电脑的情况。我特别喜欢打游戏,所以电脑下了单机游戏(100G),之后就没多少空间了,又要做生信,实在吃不消。我记得有一
2022-05-12 23:55:51
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空空如也
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