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Python_GNN-DL
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python求解含有参量常微分方程组的解析解(笔记)
本文主要利用python对求解函参量常微分方程的解析解进行演示原创 2022-12-15 22:47:27 · 992 阅读 · 0 评论 -
R语言limma包差异表达分析
本文主要是对差异表达分析进行演示,其中利用的是R包limma.原创 2022-11-11 17:00:06 · 9813 阅读 · 2 评论 -
用Python进行GEO数据挖掘(学习笔记四):富集分析
该笔记详细解释了富集分析的工作原理,并简要地利用gseapy在python中进行富集分析的操作。原创 2022-08-27 08:45:13 · 4922 阅读 · 0 评论 -
用Python进行GEO数据挖掘(学习笔记三):利用rpy2库调用R的limma包进行差异表达分析
本文详细介绍python进行差异表达分析的详细流程,其中用到了rpy2库调用了R中的limma包,最后提取了差异基因,并可视化结果。原创 2022-08-18 09:59:47 · 3972 阅读 · 7 评论 -
用Python进行GEO数据挖掘(学习笔记二):了解你的表达矩阵
这篇文章介绍的是ID转换后,对数据的内部结构进行探索原创 2022-08-15 14:21:02 · 3043 阅读 · 1 评论 -
用python进行GEO数据挖掘(学习笔记一):ID转换
重点介绍用Python进行GEO数据ID转换的操作方法原创 2022-08-12 14:38:58 · 3335 阅读 · 4 评论 -
biopython
biopython是python操作生物信息学的一个库原创 2022-06-18 12:38:53 · 196 阅读 · 0 评论 -
PCA降维的来龙去脉及Python实现
1. PCA降维的用途2. 在讲PCA降维的原理前需要知道的一些东西 2.1方差 2.2协方差 2.3向量在不同基下的坐标表示 2.4矩阵乘法 2.5矩阵的特征值和特征向量 2.6实对称矩阵正交相似于对角矩阵3. PCA降维的核心思想4.PCA降维的原理5.PCA降维的步骤总结6.Python实现PCA降维目录1. PCA降维的用途2. 在讲PCA降维的原理前需要知道的一些东西 2.1方差 2.2协方差 2...原创 2022-01-18 19:35:13 · 2324 阅读 · 4 评论 -
典型聚类——K-means算法原理及python实战
1 聚类算法简要介绍1.1 聚类是什么 聚类是机器学习中的一种重要的无监督算法,可以将数据点归为一系列的特定组合。聚类算法可以将数据点聚成不同的类,揭示数据集中蕴含的不为人知的规律,从而指导我们的生产和生活。简单地说,聚类就是将对象进行分组,使得相似的对象归为一类。对于聚类其实我们并不陌生,我们常说的“物以类聚,人以群分”指的就是聚类。1.2 聚类算法的应用场景 当聚类作为一个单独的过程时,用来寻找数据本身所蕴含的“分布结构”规律。例如,可以应用聚类结合已知的移动客户所在位...原创 2022-01-10 16:36:21 · 3000 阅读 · 0 评论 -
numpy访问矩阵最大值、最小值的位置
numpy访问矩阵最大值、最小值的位置#导入需要的库import numpy as npimport matha=np.matlib.rand(4,5) #随机生成一个4行5列的矩阵b=a.max()b1=a.min()print('矩阵的最大值与最小值:',b,b1)print(np.argmax(a)+1) #获取矩阵最大值的位置print(np.argmin(a)+1) #获取矩阵最小值的位置#运行结果:#矩阵的最大值与最小值: 0.9199080553291294 0原创 2022-01-04 22:49:07 · 5301 阅读 · 0 评论