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原创 基于pytorch实现分布式训练:DistributedDataParallel

主要矛盾:日益增长的数据、模型训练的需求与当前单卡计算能力无法满足这个需求之间的矛盾目标: 充分利用GPU的性能来提高模型学习的速度框架: PyTorch的并行计算,让多个GPU来参与训练策略: 模型并行、数据并行、混合并行分类: 单机多卡、多机多卡。

2024-10-23 21:00:04 767

原创 sequence ss_pred contains no residues错误解决思路

部署RoseTTAFold All-Atom时遇到了这个问题,部分报错内容如下。:重新下载blast,并更改bash文件中涉及的路径,具体做法参考。的问题,我使用conda重新安装psipred后成功解决这个问题。

2024-09-07 17:18:25 447

原创 Linux环境DiffDock复现遇到的问题记录

原文:DiffDock: Diffusion Steps, Twists, and Turns for Molecular Docking代码:https://github.com/gcorso/DiffDock。

2024-08-31 16:59:32 706 1

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