Ubuntu虚拟机&conda虚拟环境运行和打包引入SimNIBS软件包的python项目文件

项目背景:项目是python代码写的,其中有一个模块SimNIBS不能通过pip安装,需要自己下载软件包,在Ubuntu虚拟机的虚拟环境中运行和打包。下面是整个流程和遇到的一些问题,写下来做个记录。(默认此时SimNIBS已经安装好了,还没安装好的话,参见文章Ubuntu虚拟机安装医学影像软件包SimNIBS及报错解决-优快云博客

1.conda创建虚拟环境simnibs

重新从SimNIBS官网下载installer压缩包并解压,然后输入代码

conda create -n simnibs --clone /home/sunsun/simnibs_installer/simnibs_env

说明:--clone后面的地址是你解压的路径,找到环境文件

2.激活虚拟环境

conda activate simnibs

3.cd到项目路径下,输入pip show simnibs,如果有版本信息,就说明simnibs模块被成功引入了,python可以找到到了。到现在运行应该没问题了。

4.打包时注意不要使用pip安装pyinstaller,要使用conda安装。(如果用pip安装,打包的时候使用的python版本和包都不是虚拟环境下的,而是base环境下的)

conda install pyinstaller

5.最后打包成linux系统的单个可执行文件

pyinstaller -F --clean 主文件.py

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