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物种内共线性分析步骤——JCVI安装以及数据下载(一)安装最简单的方法是通过PyPI安装它：1234pip install jcvi#或者安装开发版本pip install git+git://github.com/tanghaibao/jcvi.git或者，如果要手动安装：12git clone git://github.com/tanghaibao/jcvi.gitpip install...

HIFI技术的简介HiFi reads（High fidelity reads）是Sequel II 三代测序平台推出的兼顾长读长和高准确度的测序序列，一般采用CCS（Circular Consensus Sequencing）模式测序。在这种测序模式下，酶读长一般大于插入片段长度，因此酶会绕着模板进行滚环测序，插入片段会被多次测序。单次测序中造成的随机测序错误，可以通过算法进行自我纠错校正，最终得到高准确度的HiFi reads。要在单次测序中得到更多的HiFi reads往往需要平衡测序的酶读长

JCVI安装以及数据下载（MCScan）安装最简单的方法是通过PyPI安装它：pip install jcvi#或者安装开发版本pip install git+git://github.com/tanghaibao/jcvi.git或者，如果要手动安装：git clone git://github.com/tanghaibao/jcvi.gitpip install -e .还有一些依赖包安装方法移步官网数据下载接下来重点说一下安装完成之后的使用，1、下载测试数据下载数据可以