R包画图出现PDF损坏

ChowLin.c

于 2024-02-28 10:49:15 发布

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文章标签： r语言 pdf

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/m0_46468289/article/details/136339918

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文章讲述了作者在使用R语言中的pheatmap函数生成PDF图时遇到问题，虽然代码正确但无法打开。随后提到转换到ggplot2并使用ggsave函数成功解决了这个问题，强调了在处理这类问题时可能需要更换绘图库的方法。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

有时候代码很正确,但是图就是画不出来

比如下面,直接生成的pdf,代码没问题就是打不开

pdf(file = "21.Pheatmap.pdf",width =8,height = 6)

tab <- table(label = pbmc.hesc$labels,cluster = pbmc@meta.data$seurat_clusters)

pheatmap(log10(tab + 10))

dev.off()

改成ggsave试试,需要先安装ggplot2包

library(ggplot2)

tab <- table(label = pbmc.hesc$labels,cluster = pbmc@meta.data$seurat_clusters)

plotPheatmap <- pheatmap(log10(tab + 10))

ggsave("21.Pheatmap.pdf", plotPheatmap, width = 8, height = 6)