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RSS订阅原创 使用DIAMOND生信软件找到MAGs中的orf
首先根据阈值 要把所有的MAG_w某某.fa和ncycdb用diamond进行比对，然后应该是生成一个个的.tsv文件，然后调用poential_fulian这个python文件吧正链负链从原来的.fa文件中找出来，生成一个个的.fa文件，最后再调用命令sudo ./ORFfinder -in output.fa（这里可能要改成批量的类似） -s 1 -ml 75 -out out_orf.out -outfmt 0，生成最终的orf的一个个.fa文件。但是现在我必须要进行下一步的多分类模型的修补工作了。
2025-02-08 15:37:47
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原创 查找硕士毕业论文参考文献中会议论文的举办地点、出版商
Proceedings 是论文集的意思。Publisher 是出版商的意思。以上仅供参考，如有纰漏请指正。
2025-02-08 15:33:57
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原创 ssh远程使用jupyter notebook
其中： -N 告诉SSH没有命令要被远程执行；-f 告诉SSH在后台执行；-L 是指定port forwarding的配置，远端端口是8889，本地的端口号的8888。例如：ssh -g -N -L 8971:localhost:8889 hxx@172.x.x.x -p 10022。如果想在远程使用jupyter的话，打开远程的服务器，输入http://172.x.x.x:8889/tree。例如：localhost:8971/
2023-11-09 16:59:41
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原创 docker里的命令
然后通过filezilla把文件传到自己主机上进行查看，在这里出现了一个小问题，连接虚拟机时显示无法连接到服务器，在网上查了很多解决方案都没有解决，之后意外发现虚拟机可以ping通主机，但是主机ping不通虚拟机，这俩ip地址压根不在一个网段上（一个是192...，一个是10...）。重新设置修改了虚拟机的ip地址之后，重启虚拟机，顺利ping通，顺利连接上，打开了这三个文件。docker exec 92ffcb90b429（容器id）ls -a /1、查看docker里有什么目录？step:和正常一样。
2023-09-19 18:41:45
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原创 spyder切换虚拟环境
从github上下载好代码的压缩包之后在自己本地运行。在spyder里切换想要的虚拟环境。2、创建好该代码所需要的环境。1、阅读readme。
2023-09-15 18:28:47
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原创 Windows本地查看虚拟环境时，配置文件报错：ConfigurationLoadError: Unable to load configuration file. path:
使用命令：conda env list。第二步：conda list。
2023-09-02 21:06:26
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原创 win10系统virtualbox中Ubuntu操作系统查看IP地址
sudo mount -t vboxsf share(“shared_file”,这个是刚才填写的文件夹名称） /home/hxy/Desktop/1("dictionary",这个是在虚拟机的系统中新建一个文件夹的路径，用来存放共享文件）u:撤销上一步操作；保存文件时：按Esc键后，按：wq（即保存退出）；ls -lh /home/hxy/Desktop/1/rnaseq-trainging.zip （使用绝对路径查看文件信息）去某个文件的第400行至500行，放到另外一个文件中：(使用重定向）
2023-09-02 17:34:13
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原创 本地安装torch步骤
4、在黑框中先转到相应位置，再进行pip或者conda install；2、根据对应版本找到torch、torchvision对应版本；3、点击下载.whl文件（记好文件所在位置）；1、确定python版本，cuda版本；
2023-07-27 16:07:32
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原创 字母拼错导致一下午时间都在解决一个不存在的问题
jupyter没有提示，还是用个vscode类似的ide吧。安装路径有问题，重新安装很多次，一直报错。学习python的pandas包时。panads,导包导不进去，以为。在jupyter中把。
2023-03-18 17:48:34
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空空如也
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