m0_45248682的博客

ROC曲线，多用于二分类问题的评价，通过选取合适的截断值（阈值threshold）便能得出AUC。但很多时候我们只是单纯地通过掉包来计算AUC并绘制ROC曲线，其中的原理和最佳阈值的筛选往往被人们忽略。同时笔者最近的项目中需要重新温习这些小细节，故撰文积累一下。（本文不以实际用途出发，若只想得出结果可以看看这篇：https://blog.youkuaiyun.com/m0_45248682/article/details/104080913）

MEGA6构建系统发生树官网地址：原官网页：https://www.megasoftware.net/MEGA简介：MEGA软件是一款遗传学分析软件，可以完成基本的序列比对，系统发生树构建和BLAST搜索，本文将简述其基本操作步骤，全程界面操作。数据来源申明：数据来源于ncbi中18种冠状病毒的基因序列，包括新型冠状病毒ncov-2019，SARS，中东呼吸症，蝙蝠的冠状病毒等等，以f...

R语言卡方分析与结果可视化1，卡方分析简介2，R语言chisq.test()3，基于ggstatsplot包的可视化分析

ggstatsplot包参数说明ggbarstats函数：ggbarstats( data, main, condition, counts = NULL, ratio = NULL, paired = FALSE, labels.legend = NULL, results.subtitle = TRUE, stat.title = NULL, sam...

R语言生信学习-ggsci包介绍–SCI论文的配色对于我这条使用R语言来绘图的生信????而言，最令我绝望的便是关于配色的问题了，很多时候自己选的颜色看上去会特别生硬，就算使用colorRampPalette产生渐变色也感觉不够理想。无意间，我看到了“ggsci”这个包，它完全就是为了SCI配色而设计的，下面我将挑选一些重要的来讲，详细的内容可以去看官网的说明。内置函数介绍：这些是帮助页面中的函数...

（生信）RNA蛋白编码预测软件-CNCI的使用CNCI简介：CNCI是由中科院研发的一款基于SVM（支持向量机）的LncRNA预测软件，它可以不依赖于已知的RNA注释信息来进行预测，同时其对不完全转录和反义的RNA有着良好的分类效果，本文将根据github的说明总结一些简单的操作。软件安装与准备：linux 32位或者linux 64位系统python 2.74或者2.0版本（详细安装...