
生物信息学
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生信知识笔记,有趣问题,软件、分析、作图等等
小柴犬冲冲冲
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【问题记录2:R-clusterprofiler-barplot()中的报错】
报错:barplot(gene_GO_all,showCategory = 20,title = “GO enrich result(all)”)Error in ans[ypos] <- rep(yes, length.out = len)[ypos] : 更换参数长度为零此外: Warning message:In rep(yes, length.out = len) : ‘x’ is NULL so the result will be NULL在画图的时候,遇到这样一条报错。解决:原创 2022-01-07 20:16:29 · 4309 阅读 · 4 评论 -
【问题记录1:R-ClusterProfiler相关包安装失败】
在我以为ClusterProfiler已经安装好的时候,又遇到了一些问题。后遂记录一下这些问题和解决方法。报错1:BiocManager::install(“org.Hs.eg.db”)Warning messages:1: In file.copy(savedcopy, lib, recursive = TRUE) :拷贝C:\Users\xyf\Documents\R\win-library\4.0\00LOCK\graphlayouts\libs\x64\graphlayouts.d原创 2022-01-07 20:09:19 · 21096 阅读 · 5 评论 -
【R-clusterProfiler包安装经验】
前言这几天打算开始学习一下富集分析,发现这个R中的包:clusterProfiler,遂打算下载安装,开始学习。关于安装的经验也记录一下,以后可能用得上,也可以给需要的人提供下参考。1.下载安装方法首先,这个包不能够通过常规的install.packages()安装,需要通过Bioconductor,这个是很多生物分析相关的包的管理器,我暂时还不是很懂,也不好瞎介绍。在官网就有下载的介绍:Bioconductor-packages-clusterProfiler也有很多关于这个包的介绍。if原创 2022-01-05 16:11:27 · 8531 阅读 · 0 评论