FreeSurfer

最新推荐文章于 2025-05-21 13:48:53 发布
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分类专栏： MRI 文章标签： fMRI
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1.Brain volume
aparcstats2table –subjects *h.aparc.stats(Freesurfer 文件夹下stats文件，注意文件名只能取这个，否则找不到文件)

FreeSurfer的安装及使用（个人踩坑记录）
Y000077的博客
01-23 3万+
一、环境要求 目前只支持在Linux和MacOS系统，虽然可以用 -parallel 进行多线程处理，但基本消耗的是CPU内存。 二、FreeSurfer的下载与安装 1. 下载安装包 官网链接：rel7downloads - Free Surfer Wiki 根据自己系统型号下载对应安装包，我的电脑是Ubantu18.2的，下载的是freesurfer-linux-centos6_x86_64-7.2.0.tar.gz，记得科学上网，不然下载要二十多个小时。 或者直接在官网复制下载链接后，
win10和Mac上安装Freesurfer
Daily_365的博客
11-07 5657
Mac安装Freesurfer 软件下载地址 可以根据官方给出的demo视频一步一步下载
使用freesurfer来划分脑区：探索大脑奥秘的利器
最新发布
gitblog_06784的博客
05-21 1077
使用freesurfer来划分脑区：探索大脑奥秘的利器 去发现同类优质开源项目:https://gitcode.com/ 项目介绍 在脑科学领域，脑区的精确划分对于理解大脑结构和功能至关重要。本文将为您详细介绍一种高效、精确的脑区划分方法——使用freesurfer软件。通过该方法，研究人员可以轻松实现对大脑各区域的精确识别和划分，为后续的脑科学研究提供坚实基础。 项目技术分析 freesurfe...
FreeSurfer图像分析软件在视觉功能磁共振研究中的运用
11-19
FreeSurfer在核磁图像的运用的一篇论文
freesurfer简单使用
weixin_51192938的博客
11-08 739
【代码】freesurfer简单使用。
使用freesurfer来划分脑区
12-08
有关脑区划分的文章，使用该文章可以为我们提供很好的思路
freesurfer:神经影像分析和可视化套件
04-08
FreeSurfer是一个软件包，用于分析和可视化来自横截面和纵向研究的神经影像数据。 它是由开发的。 FreeSurfer提供了用于结构和功能MRI的完整处理流，并包括用于线性和非线性配准，皮质和皮质下分割，皮质表面重建，...
matlab齿轮代码-freesurfer-recon-all:执行FreeSurfer皮质重建过程的全部或任何部分
06-16
scitran/freesurfer-recon-all 此构建上下文将创建一个构建到 的映像，该映像可以在 内或本地执行 Freesurfer 的 recon recon-all ( v6.0.1 )。 您必须阅读并同意许可协议和 。 获得许可证后，您可以在构建容器之前...
freesurfer-linux-centos6_x86_64-7.2.0.tar 之二
09-25
freesurfer自己需要时只能慢吞吞用10+kb的速度下载，文件5个G，要下载3天半，非常费时，故上传资源，需要可自行下载。因为每次上传不能超过1G，所以分了几个帖子。第二节。
freesurfer使用教程.pdf
09-30
Freesurfer 使用教程 Freesurfer 是一个强大的工具，用于处理大脑 3D 结构像数据，进行自动皮层和皮下核团分割。它提供了详细的教程和wiki，但是命令参数非常复杂，难以记忆。在这里，我们将简洁地总结 Freesurfer ...
Python库 | freesurfer_surface-1.2.0-py3-none-any.whl
02-16
《Python库：freesurfer_surface-1.2.0-py3-none-any.whl的深度解析》 在Python的世界里，丰富的库是其强大功能的重要支撑。今天我们要聚焦的是一款名为freesurfer_surface的Python库，它封装了FreeSurfer工具集的...
PyPI 官网下载 | freesurfer_surface-1.2.0-py3-none-any.whl
01-05
资源来自pypi官网。 资源全名：freesurfer_surface-1.2.0-py3-none-any.whl
FreeSurfer的安装教程
10-17
FreeSurfer的安装教程，如果有问题，欢迎留言，一定全力解决
在win10中下载FreeSurfer（Ubuntu20.04）
qq_51204441的博客
04-25 1132
首先需要在win10中用wsl下载linux，可以参考这篇，写的非常详细，
ABIDE Preprocessd 结构态MRI数据集介绍及下载（FreeSurfer流程）
罟霖同学的站点
06-27 1984
本篇面向于ABIDE Preprocessed数据集中Freesurfer预处理的结果数据，介绍了输出文件较为重要的几项，以及如何从中获取脑区的形态学特征。
FreeSurfer5.3.0下载安装配置
quxiaoxia1986的专栏
03-20 6166
安装配置完了FreeSurfer，整理了步骤，分享给大家。
Freesurfer的简单使用和一些基础知识
热门推荐
lh16130130282的博客
05-15 1万+
Freesurfer的一些简单使用和基础知识
CentOS7安装FSL，FreeSurfer
weixin_41948388的博客
01-14 3578
安装FSL 1） 下载py文件 网址：https://fsl.fmrib.ox.ac.uk/fsldownloads/fslinstaller.py ，打开网址填写相关资料后下载python文件 2） 安装 打开终端，进入root状态下后，运行以下指令（其中“/home/user/下载”可以替换为其他包含“fslinstaller.py”文件的位置）： cd /home/user/下载 默认...
Windows下安装FreeSurfer教程
weixin_43012017的博客
11-23 2427
FreeSurfer 是一个开源软件包，用于分析和可视化横断面和纵向研究的结构、功能和扩散神经成像数据。它由Athinoula A. Martinos 生物医学成像中心的计算神经成像实验室开发。
FREESURFER
03-31
### 关于Freesurfer软件的安装与使用 Freesurfer是一款用于分析脑部影像数据的强大工具集，广泛应用于神经科学领域中的结构和功能磁共振成像研究。以下是关于Freesurfer软件的一些基本信息及其安装指南。 #### Freesurfer的功能概述 Freesurfer提供了一系列算法来处理MRI图像，包括皮层重建、体积分割以及表面建模等功能[^2]。它能够自动完成大脑皮质厚度测量、白质病变检测以及其他复杂的解剖学特征提取任务。 #### 安装指导 对于Linux系统的用户来说，可以通过下载官方发布的二进制包来进行安装；而对于Mac OS X平台，则推荐利用Homebrew Cask途径获取最新版本的应用程序文件夹并按照指示操作即可成功部署环境配置工作流程所需的一切组件[^3]。 需要注意的是，在正式运行任何脚本之前，请务必确认已正确设置了必要的环境变量（如`$FREESURFER_HOME`），并且加载了所有依赖库项以支持图形界面显示或者批处理模式下的后台作业管理机制正常运转[^4]。 ```bash source $FREESURFER_HOME/SetUpFreeSurfer.sh ``` 上述命令是用来初始化当前shell session内的freesurfer相关设置的一个典型例子。 #### 使用实例 假设我们有一个名为subject1的数据目录路径为~/data/subject1/,那么可以执行如下recon-all指令启动完整的个体化三维模型构建过程： ```bash recon-all -subjid subject1 -i ~/data/subject1/mri.nii.gz -all ``` 此命令将会依次调用多个内部模块逐步实现从原始扫描图片到最终统计量输出之间的转换链条上的每一个环节直至结束整个流水线运作周期为止[^5]。
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