MRI数据处理：如何打开.nii文件及其他

最新推荐文章于 2025-06-18 15:18:51 发布
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分类专栏： MRI
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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/lxqlxq21/article/details/45049599
本文介绍如何使用MATLAB进行NII文件的读写操作，并提供了具体的代码示例。此外，还列举了一些常用的MRI数据处理软件如fsl、afni及workbench等，并提到了fsl中的GLM方法用于提取braintaskmapping。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

在matlab中：

addpath('/usr/local/matlab.etc/');

load_nii('文件名');

save_nii(nii,'文件名');

ex: SROInii.hdr=data.hdr;
      SROInii.img=SROI;
      save_nii(SROInii,'SROI.nii');


其他经常用于读取MRI数据的软件：fsl和afni(常用于DTI); workbench(用来显示3D图像)


fsl中可以用于提取brain task mapping的方法GLM(General linear model)

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"numTraining": 80, "numTest": 20, "training": [ {"image": "./imagesTr/patient_001_0000.nii.gz", "label": "./labelsTr/patient_001.nii.gz"}, {"image": "./imagesTr/patient_001_0001.nii.gz", "label": ""}, {"image": "./imagesTr/patient_002_0000.nii.gz", "label": "./labelsTr/patient_002.nii.gz"}, {"image": "./imagesTr/patient_002_0001.nii.gz", "label": ""} ], "test": [ "./imagesTs/test_patient_001_0000.nii.gz", "./imagesTs/test_patient_001_0001.nii.gz", "./imagesTs/test_patient_002_0000.nii.gz", "./imagesTs/test_patient_002_0001.nii.gz" ] "numTraining": 80, 是指imagesTr文件总数么，还有 {"image": "./imagesTr/patient_002_0000.nii.gz", "label": "./labelsTr/patient_002.nii.gz"}, {"image": "./imagesTr/patient_002_0001.nii.gz", "label": ""} 多模态为什么要这么写
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