五月的田野

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官网 https://atom.io/丰富的插件 https://atom.io/packages快捷键Ctrl shift M 预览 markdown Ctrl shift P 命令行插件emmet 强大的代码补全minimap 是一个预览全部代码的一个插件file-icons 文件图标pigments 颜色显示atom-beautify ...

常用的几个命令：i 切换到输入模式，以输入字符。x 删除当前光标所在处的字符。: 切换到底线命令模式，以在最底一行输入命令。

安装最新版 https://www.rstudio.com/products/rstudio/download-server/设置不同R内核 https://support.rstudio.com/hc/en-us/articles/200486138-Using-Different-Versions-of-RRstudio 参考书 http://docs.rstudio.com/ide/...

命令详解pigz 高效多线程，可代替gzip# 压缩：pigz：用法-9是压缩比率比较大，-p是指定cpu的核数。tar cvf - mydir | pigz -9 -p 24 > file.tgz# 解压: pigz -d file.tgzpigz -dc file.tgz # cat的形式打印出来Options: -0 to -9, -11 ...

github地址： https://github.com/sanger-pathogens/assembly-stats.git安装conda install assembly-stats使用介绍，如果是多个结果，为了阅读方便，可以存为csv格式# 列头echo faname,sum,ave,largest,N50,N60,N70,N80,N90,N100,N_count,Gap...

官网：http://cmder.net/ cmder是一个增强型命令行工具，不仅可以使用windows下的所有命令， 更爽的是可以使用linux的命令,shell命令。添加 cmder 到右键菜单： 环境变量添加后，在任意文件夹中即可打开Cmder， 在管理员权限的终端输入以下语句即可: Cmder.exe /REGISTER ALL...

常用的高效率命令软件，命令图片格式（jpg png tiff pdf）之间转化# ImageMagick # pdf 转换为jpgconvert -density 300 file.pdf file.jpg# 转化为黑白图（灰度图）convert -density 288 a.pdf -resize 75% -colorspace GRAY out.pngPDF处理（...

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FaQCs 使用perl编写，R画图。不仅可以统计质量，Q30，还可以trim序列。安装简单准备好两个需要的perl 模块,下载github上的文件，然后直接cd lib;./INSTALL.sh。 https://github.com/LANL-Bioinformatics/FaQCsfastqc java写的，速度快，结果清晰，但结果没有Q30比值 http://www.bioinf...