绘制超好看的云雨图和小提琴图！

云雨图&小提琴图的作用

1. 云雨图（Half-Violin Plot）

定义

云雨图是一种结合了 小提琴图 和 散点图 的图形表现形式，其中：

• 一侧展示小提琴图（通常用于显示数据的分布密度）。
• 另一侧叠加散点图，展示每个数据点的原始数值分布。

特点

• 半小提琴图（half-violin）：将传统小提琴图切为一半，通常位于图形的右侧或左侧。
• 散点图叠加：用于展示每个数据点的具体位置，从而避免分布密度掩盖数据细节。

作用

• 数据分布和细节并重：
  • 小提琴部分展示数据的全局分布（如峰值和尾部情况）。
  • 散点部分提供具体的观测点分布，帮助发现异常值或分布的离散程度。
• 易于分组对比：适合分组数据的可视化（如不同实验条件、类别变量）。

2. 小提琴图（Violin Plot）

定义

小提琴图是一种结合了 箱线图 和 核密度图 的数据可视化工具，用于描述数据的分布形态。

特点

• 中心部分包含一个 箱线图，显示分布的五数概要（最小值、第一四分位数、中位数、第三四分位数、最大值）。
• 两侧对称展示 核密度估计，表示数据的分布密度。
• 形状宽度反映数据分布的密集程度（宽的部分表示该范围内的数据点更多）。

作用

• 显示数据分布形态：
  • 比单纯的箱线图更详细，能够直观地看到数据分布的偏态、峰值和多模态特征。
• 数据对比：
  • 特别适合多个分组的数据比较。
  • 不同宽度的区域展示了各分组的分布差异，例如分布是否对称、是否存在多个峰值。
• 整合数据摘要：
  • 通过同时显示箱线图和核密度估计，小提琴图提供了数据的全景视角。

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数据结构

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云雨图代码

1. 导入库和读取数据

library(ggplot2)
library(dplyr)
library(RColorBrewer)
library(viridis)
library(ggpubr)
library(rstatix)
library(gghalves)
library(patchwork)
library(openxlsx)

data1 <- read.xlsx("aaa.xlsx")
data1$prob <- factor(data1$prob)
data1$outcome <- factor(data1$outcome)
data1$delay <- as.numeric(data1$delay)

• 加载库：

  • ggplot2：主要用于数据可视化。
  • dplyr：用于数据过滤和处理。
  • openxlsx：读取 Excel 数据。
  • 其他库（如 gghalves）提供了额外的绘图功能，如半小提琴图。

• 数据预处理：

  • 使用 read.xlsx 读取 Excel 文件 aaa.xlsx。
  • 将 prob 和 outcome 转换为因子（分类变量），便于分组绘图。
  • 将 delay 转换为数值型，以便用于数值分布图。

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2. 定义颜色映射