PyClone 安装,报错(Invalid DISPLAY variabl)及解决

本文档详细介绍了在安装PyClone时遇到的Invalid DISPLAY变量错误及其解决方案。错误发生于matplotlib的配置不当,解决方法包括修改matplotlibrc文件,全局设置后端为Agg,以便在远程服务器上正确运行。通过调整配置文件并重新执行安装命令,问题得以解决。

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1、 PyClone 安装,报错及解决

1.1、 安装

conda install PyClone

命令如下:

PyClone run_analysis_pipeline --in_files SRR385938.tsv SRR385939.tsv SRR385940.tsv SRR385941.tsv --working_dir ./tt

1.2、 报错:

Traceback (most recent call last):
  File "/home/lixy/miniconda2/envs/ngs2/bin/PyClone", line 11, in <module
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