19、生物系统建模：确定性建模与生物振荡分析

生物系统建模：确定性建模与生物振荡分析

1. 确定性建模

1.1 模型拟合优化

在模型拟合优化方面，我们可以使用遗传算法和差分进化算法。以下是Python中使用差分进化算法进行模型拟合优化的代码示例：

Act_Enzy_exp = Enzy_exp
plot_sw = False
bounds = [(-0.99, 0.99)] * delta_dim

from scipy import optimize
result = optimize.differential_evolution(Santillan_Model_Fit_Cost,
                                         bounds,
                                         args=(time_span, time_exp, Act_Enzy_exp, plot_sw),
                                         updating='deferred',
                                         disp=True,
                                         popsize=200,
                                         maxiter=100,
                                         workers=4)

1.2 最优解