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原创 R进行各种变量下的cox回归分析,重要的是还将输出结果以表格形式转出
关于单变量cox回归、批量单变量cox回归、有序变量下的cox回归、将cox回归结果以表格形式输出的系列内容
2024-02-05 11:27:50
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原创 用R绘制经典风险三联图(适合新手入门)
补充说明下:我的数据是模拟训练数据用,实际操作中可能会困难重重,但一步一步来,先了解这个风险三联图和基本的命令,也有助于对R的认识。虽然风险三联图用的不多,但怎么说呢,咱们并不是非要三个图都有,cox回归中看哪个更好解释数据,就用哪个吧,技多不压身。我自己随便凑的一些数据,也没有检验,应该是不太符合常规检验操作的,拿来练手还是行的。画出来的图还凑合,但具体怎么解释还是欠缺的 我得多看看文献。
2024-01-30 18:37:22
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原创 如何解决R的问题: package ‘survcomp’ is not available for this version of R
我顺着给出的链接进去查看问题,但好像也解决不了,百度的结果是可以直接下载源代码,但我也没搜到survcomp的源代码安装包,这个办法只好作罢。其他的结果根据系统提示来,没问题的!
2024-01-29 12:12:35
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原创 如何用R的绘制高颜值的列线图、校准曲线和DCA曲线?
做出高颜值的列线图、校准曲线,同时关于图的图例“legend()”函数、“plots() ”函数在这个绘图中的作用稍作演示,希望做出更好看、更直观的图片
2024-01-25 20:45:24
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原创 R语言报错 Error in eval(predvars, data, callenv) :没有发现XX
我寻思着难道是我变量有问题?我索性删除没有找到的变量,继续执行这个命令,结果系统还是原提示,XX改为删除变量后排第一的YY了。我跟着输进去,结果出错了, Error in eval(predvars, data, callenv):没有发现XXX。我改了,突然想到,人家的数据集名称就是 LIRI。Ps:在R语言中,cph函数是一个常用的。我的数据集名称是 Mydata。
2024-01-08 16:06:42
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原创 R语言绘制ROC曲线时报错:Error in roc.default(XXXX) : No valid data provided.
所以我应该改为和自己的一样,写上数据集名称$结局名称,数据集名称$变量名称。错的是后面,刚好人家对应的结局指标是叫 outcome,变量是叫ndka。人家是的df是自己的数据集名称,我的是Mydata,没错。
2023-12-14 11:27:35
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原创 在安装filmage screen时,系统提示我找不到文件,在此之前已有“EXE和MSI文件签名不匹配”的提示。
对话框,依次打开HKEY_LOCAL_MACHINE-SOFTWARE,找到Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run,双击。这里的D改为自己要检测的盘,我选择的是D盘,在扫描过程中,D盘所有文件程序都无法访问的,检测的结果也来的很快,没发现什么问题,按照网上搜索的教程,推测应该是我删除文件时删除不完全导致,提示我WIN”键+“R”键打开运行,输入 regedit;我选择【是】,但是系统却删除不了,那个项目还是稳妥的坐在那儿。下一个办法,打开命令提示符,输入。
2023-12-08 10:09:09
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原创 每次打开RStudio都会提示我“git”命令需要使用命令行开发者工具,什么意思?
我一直忽略了,因为点击下载后又下载不了,就干脆忽视它了,但隐隐的感觉和我的rstudio使用有关,果不其然中,在我下载Hmisc包的时候,系统一开始提醒我镜像链接有问题,还没反应来,一连串的好多好多红色,我的心都碎了,看都看不过来。但是能怎么办呢,挨个往下看吧,首先是镜像链接的问题,但怎么说呢,还没等我处理这个问题,系统自动蹦出来其他的问题。我的问题仍然没有解决。我觉得,我不想用这个系统了,还是换用win系统吧 改天解决了再来分析那个问题。下一步就是下载、安装了。
2023-12-07 23:01:59
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原创 R语言在安装程序包时显示:Warning in install.packages :
今天在重新使用rstudio时出现这种提示,我找了很多解决办法,包括在tools里修改packages的镜像,但是用处不大。就在tolls里面重新选择另外一个镜像连接,就可以了。兴许是这个镜像链接打不开。又看到了一位朋友说,直接卸载r,重新选择镜像?
2023-12-07 21:42:15
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原创 Mac系统安装R及Rstudio软件步骤详解,尤其是很久没有更新mac系统的,找到适配的R和低配版的Rstudio不是个容易事儿啊
平常用的台式机还是win系统,还是我喜欢的win10系统,这就意味着我在安装一些软件时不用考虑到版本的问题,之前还是win7系统的,在安装R和Rstudio中吃尽了苦头。我打开后也能用,但是,具体忘记了,好像是这个图标确实有点不好看,显老旧的样子,而且这个版本Rstudio不能与4.2版的R一起用哟!这个链接里的放的是RStudio的1.4.1106版exe安装,适合mac的10.13+系统,我用的是R是3.6.3(2020-02-29)版的,这两者可以用的上,这个版本的R不至于很老,虽然不是最新的。
2023-12-05 22:56:11
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原创 继R绘制列线图之后的模型验证(包括内、外部),适合新手上路(无废话)
涵盖回归模型的验证理论+内部验证+外部验证详细命令和解说,遇到bug解决bug,用大bug打败小bug
2023-12-04 21:28:35
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原创 R语言绘制列线图构建(以二分类Logistic为例)超详细
COX回归分析不少见,但是简单异性的以二分类结局进行的回归分析更多,由于研究设计的研究便行,也是初次投稿的小白们比较理想的选择对象,二者的过程基本相似,但所用函数略有区别,从浅到深,先以二分类结局的Logistic回归为例,讲解一下有一组102例患者,来分析6个变量(old+bedridden time +EN + Probiotics + Albumin + Antibacterials)对是否发生某个并发症的影响。此处并发症是否发生是个二分类变量,就简单命名GROUP。
2023-12-02 00:00:00
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原创 使用R时出现警告:The following objects are masked from ‘package:base’: format.pval, units
使用R时加载Hmisc包出现警告:The following objects are masked from ‘package:base’: format.pval, units
2023-12-01 12:52:13
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空空如也
空空如也
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