Kenina_Xie的博客

HiC数据分析介绍

生信软件安装教程： HiC-Pro安装教程

生信软件安装

x = datetime.date(2020,1,1)y = x + datetime.timedelta(days=54)ydatetime.date(2020, 2, 24)

如何得到两个文件的交集、并集和差集？交集：两个文件中都出现的行并集：两个文件中的所有行加起来，去掉重复差集：在一个文件中存在，而在另一个文件中不存在。比如以下两个文件：a.txtaaabbbccc111222b.txtcccdddeee111333结果：a.txt和b.txt的交集：ccc111a.txt和b.txt的并集：111222333aaabbbcccdddeeea.txt中存在b.txt中不存在：222aaabbbb.txt中存在

window安装pandas模块1.安装python环境。2.启用cmd，去到python环境目录下scripts文件夹，执行pip install pandas。

比较全的安装教程。https://ngs-data-for-pathogen-analysis.readthedocs.io/zh_CN/latest/appendix/edirect.html

像我这样的运气也是没谁了。如果哪位大佬知道解决办法，请不吝赐教，谢谢????$wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/entrezdirect/edirect.tar.gz-bash: wget: command not found$yum -y install wget-bash: yum: command not found$which ruby...

转载自：https://cloud.tencent.com/developer/article/1450128Edirect是非常有用的工具其使用要用来perl，mac都预先安装了perl安装的时候最好按下面进行打开终端cd ~/bin/bashperl -MNet::FTP -e \ '$ftp = new Net::FTP("ftp.ncbi.nlm.nih.gov", ...

1.把list写进文件时：TypeError: expected a character buffer object修改write(xlist)成write(srt(xlist))。EOL while scanning string literal未。tuple index out of range未。4.mac升级系统到catin?a什么的之后，mvdir都不行...

出现Read-only file system的地方mac升级之前只要获得权限后就可以在几乎任何目录下新建和删除文件。但是当mac升级到最新的版本catalina后，当在根目录或者其他系统目录下进行文件修改就会提示：Read-only file system解决办法：关闭 sip，终端输入sudo mount -uw /附上关闭sip的办法查看SIP状态在终端中输入csrutil...

一、NCBI各类数据储存库1、Sequence Read Archive (SRA)：raw sequence data and alignment information fromhigh throughput sequencing platforms including 454, illumina, SOLiD and PacBio.此外， European Nucleotide Arc...

1.下载python3 for MacOS。2.终端查路径，which python3。3.输入代码：PATH=“路径”4.import PATH5. source ～/.bash_profile6. 就好啦！如图：

Bio模块：Mac系统和Windows系统都是pip install biopythonMac的2.7使用bio模块时，会提示2.7走到生命尽头了BeautifulSoup模块：Windows的系统导入方法：1.下载BS4模块：http://www.crummy.com/software/BeautifulSoup/bs4/download/4.3/beautifulsoup4-4...

自己平常用MacOS，但是在公司时，出于对接需要又必须用Windows。为避免混淆，Mark一下这两个不同的OS 装python环境的一些注意事项：pythonIDE：官网下载，2.7和3.7语法上比如括号、引号稍有差别。要学3.7可以看廖雪峰的博客，3.7比2.7多出的功能我暂时用不到Mac 自带的2.7暂时够用了，参考书也使用的2.7，暂时没遇到bug，但 2.7已经停止维护了哭唧唧。。。...

有时候当我们想要亲自翻译并记录某个英文文献时，会先把pdf中的原文粘到word或者记事本里。由于pdf排版的原因，粘来的文献段落里有大量的换行符。如何批量去掉这些换行符，包括但不限于以下方法：法一：word查找替换功能case1：若换行符是硬回车，即向下再左拐弯的箭头，操作“全选-查找-高级搜索-特殊格式-段落标记 ^p 替换-高级搜索-特殊格式-分栏符^n"。查找和替换那两栏选项操作...

qiime:http://qiime.org/install/install.htmlminiconda:https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.htmlMac OS or later version operation system.1.Download and install miniconda.2.Create your qii...

0.Open the Terminal.app (found in Applications -> Utilities) and copy & paste the command below into it (then press the ‘return’ key):curl -L http://xrl.us/installperlosx | bash1.Once this is...