17、肿瘤学中基于RNA - seq数据的生存预测及微生物群落决策模型研究

肿瘤学中基于RNA - seq数据的生存预测及微生物群落决策模型研究

在肿瘤学研究以及微生物群落模拟领域，有许多重要的研究成果和方法值得探讨。下面将分别介绍基于AFT - 对数正态模型的生存数据模拟与预测，以及微生物群落决策模型在不同培养环境下的应用。

基于AFT - 对数正态模型的生存数据模拟与预测

在模拟生存数据时，为了生成不满足比例风险假设的生存数据，我们采用AFT/对数正态模型进行模拟。

模拟过程

• 生存时间与基线函数 ：生存时间遵循对数正态分布$LN(\mu, \sigma)$，其累积风险函数的逆可表示为特定公式，生存时间可通过以下公式模拟：
  $T = \frac{1}{\exp(\beta^T X_{i.})} \exp(\sigma\varphi^{-1}(U) + \mu)$
• 对数正态分布参数的选择 ：为使模拟数据的分布接近真实数据，我们按照特定方法选择生存时间分布的参数$\sigma$和$\mu$，其值可通过以下显式公式获得：
  $\mu = \ln(E(T)) - \frac{1}{2}\sigma^2$ 和 $\sigma^2 = \ln(1 + \frac{Var(T)}{(E(T))^2})$
  已知期望和标准差分别为2325和1304时，用于模拟生存数据的$\mu$和$\sigma$值分别为$\mu = 7.73$和$\sigma = 0.1760$。

模拟研究结果

以下是不同方法在AFT/对数正态模拟中的预测结果：
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