R shiny写一个简单的功能

该博客介绍了如何使用R语言的Shiny库创建一个交互式应用,用户可以上传VCF文件,然后应用将计算并展示不同SNP(单核苷酸多态性)的数量分布图。通过ggplot2库生成的图形可以在PDF和PNG格式下保存,并提供下载按钮供用户下载。应用的核心功能是解析VCF文件,统计SNP频率,并利用histogram函数生成图表。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

初学shiny,实现一个简单的功能:上传VCF文件,输出不同SNP数量图

shiny代码:

library(shiny)
library(vcfR)
library(tidyr)
library(ggplot2)
source("VCF.R")
# Define UI ----
ui <- fluidPage(
  #titlePanel("title panel"),
  
  
  fluidRow(
    column(4,fileInput("counts", multiple = FALSE, accept = c(".vcf",".gz"), h3("Input your vcf file.")))
  ),
  
    fixedRow(
      
      column(4,actionButton("run", label = "Plot", icon = icon("paper-plane")))
      
    ),
  
    hr(),
  
    fixedRow(
      
      
    column(1,downloadButton("downloadData", "Save PDF")),
  
    column(1,downloadButton("downloadData1", "Save PNG")),
  ),
  
  
  
  fixedRow(  
    mainPanel(plotOutput("map"))
  )
)

# Define server logic ----
server <- function(input, output) {
  
  td <- getwd()
  
  options(shiny.maxRequestSize=100*1024^2)
  
  data 
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