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跨学科视角展现 -- 计算思维
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Python和R统计检验比较各组之间的免疫浸润
统计检验用于比较各组间的免疫浸润差异,通过定量分析特定免疫细胞的浸润水平,评估它们在不同条件或组别下的显著性变化。常用方法包括t检验、Mann-Whitney U检验、ANOVA或Kruskal-Wallis检验,选择依据数据分布及样本特点。这些分析可揭示免疫微环境特征,助力探索疾病机制、预测治疗效果或筛选潜在生物标志物,为精准医学提供数据支持。原创 2024-11-26 10:35:28 · 897 阅读 · 0 评论 -
Python和C++急性损伤空间结构
急性肺损伤 (ALI) 的空间结构,包括其严重形式急性呼吸窘迫综合征 (ARDS),反映了肺内细胞和分子变化的复杂相互作用。这些变化破坏了正常的肺泡结构和功能,导致气体交换受损。可以使用编程技术来研究人类急性肺损伤 (ALI) 的空间结构,以分析和模拟肺部病理特征的分布和组织。原创 2024-11-24 13:02:54 · 900 阅读 · 0 评论 -
Python和R基因组及蛋白质组学和代谢组学
基因组病理学是一门将基因组学和病理学相结合的领域,旨在了解癌症等疾病的分子基础及其在细胞水平上的进展原创 2024-11-24 10:43:04 · 985 阅读 · 0 评论 -
Python和Julia(多语言)急性呼吸窘迫综合征
急性呼吸窘迫综合征 (ARDS) 是一种严重的肺部疾病,其特征是炎症、肺泡损伤和气体交换受损。基于 Python 的模型可以模拟 ARDS 病理生理学,尤其侧重于气体交换、肺顺应性和机械通气效果。原创 2024-11-23 11:31:05 · 882 阅读 · 0 评论 -
Python和MATLAB示例临床因素分析
临床因素是影响患者诊断、治疗和预后的关键要素,涵盖症状、病史、体征、实验室检查结果及影像学资料等。它们帮助医疗专业人员全面评估患者的健康状况,制定个性化治疗方案。同时,患者的年龄、性别、既往病史及生活方式等也属于重要临床因素,直接影响疾病发展与管理效果。原创 2024-11-22 19:12:45 · 423 阅读 · 0 评论 -
Python和R荧光分光光度法
荧光分光光度法是一种分析方法,通过测量物质在吸收光能后发射的荧光来定性和定量分析样品。该技术基于分子在受到特定波长的激发光照射时从激发态返回基态时发射荧光,发射光的强度和波长特征用于分析。此方法具有高灵敏度和选择性,适用于检测极微量的化合物,广泛应用于化学分析、生物医学研究和环境检测等领域。其优点是干扰少、响应迅速,但对光源稳定性和检测条件要求较高。原创 2024-11-22 19:09:33 · 952 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和C++及Python流式细胞术
流式细胞术是一种高效的实验技术,用于分析和分选细胞等颗粒物质的物理和化学特性。通过将样本以液流形式传输至激光束下,细胞的光散射和荧光特性被检测器记录,进而提供数据。该技术能够在短时间内分析数千个细胞,提供有关大小、形状及标志物表达的信息。流式细胞术广泛应用于免疫学、肿瘤学和微生物学等领域,用于诊断疾病、分析免疫细胞状态和进行细胞分类。它以其高通量和多参数检测的优势在生物医学研究中极具重要性。原创 2024-11-19 18:18:28 · 1650 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和Python发射光谱
发射光谱是指当原子或分子吸收能量后从激发态返回到较低能态时,以特定波长释放的光。每种元素的电子跃迁会释放不同波长的光,形成独特的光谱线。这些光谱是离散的,可通过光谱仪检测。由于每种元素的发射光谱独一无二,它们被用于元素分析和识别,尤其在天文学和化学领域中,帮助科学家了解物质的成分和物理状态,如恒星的大气成分和温度。原创 2024-11-19 14:49:00 · 651 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和Python激发光谱
激发光谱是一种用于研究物质发光特性的分析方法。当样品吸收特定波长的光时,电子从基态跃迁至激发态。随后,当电子返回基态时,会发射出光子,产生荧光或磷光。激发光谱通过测量不同波长的入射光激发下的发光强度来获取数据。该技术用于识别物质的结构和组成,因为不同物质的电子跃迁特性不同,因此具有独特的激发光谱。广泛应用于材料科学、生物化学和化学分析领域。原创 2024-11-18 21:04:17 · 1424 阅读 · 0 评论 -
Python和MATLAB及Julia示例3D残差U-Net
在 Python 中实现 3D 残差 U-Net 涉及使用深度学习框架,如 PyTorch。3D 残差 U-Net 结合了 U-Net 的分割能力和残差网络的优势,适用于医学图像分割等需要处理三维数据的任务原创 2024-11-17 22:21:18 · 768 阅读 · 0 评论 -
Python和MATLAB及Julia表面生长模型
卡达尔-帕里西-张(KPZ)模型是一种用于描述非平衡生长现象的随机微分方程模型,特别用于理解表面生长及类似物理过程中的随机扰动和非线性效应。KPZ方程的一般形式如下:原创 2024-11-16 17:43:11 · 762 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和Python及C++米氏散射
米氏散射(Mie scattering)是光与球形颗粒相互作用时的散射现象,对于散射粒子的直径与波长在相近的范围内时尤为重要。使用MATLAB进行米氏散射的计算涉及特定的函数和数值方法。原创 2024-11-14 14:02:13 · 1705 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和Python及R瑞利散射
在MATLAB中处理瑞利散射(Rayleigh scattering)通常涉及到理解和应用瑞利散射公式。瑞利散射描述了当光波与比其波长小得多的粒子(如气体分子或小颗粒)发生相互作用时,散射光的强度与波长的关系。原创 2024-11-14 11:20:17 · 2030 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和R及Python伪时间分析
伪时间分析是一种用于研究细胞在分化或响应特定刺激过程中的动态变化的方法。这种技术在生物信息学中尤其常用于处理单细胞 RNA 测序数据,以理解细胞状态在不同时间点如何演变。结合 MATLAB 进行这种分析可以帮助检测和分析不同条件下的选择性扰动效应,如药物处理或基因编辑。原创 2024-11-10 18:59:36 · 1058 阅读 · 0 评论 -
R和MATLAB及Python混合效应模型
使用 R 进行混合效应模型的分析是一种强有力的方法,尤其在研究带有嵌套或重复测量的复杂数据结构时。混合效应模型能够有效地检测和分析多层级数据中的固定效应和随机效应,这在研究选择性扰动效应时尤为有用。原创 2024-11-10 17:45:08 · 1307 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和Python及R潜变量模型和降维
在 MATLAB 中,潜变量模型 (Latent Variable Models, LVMs) 和降维技术被广泛用于复杂数据的分析,例如基因表达数据或其他高维数据集。这些工具有助于揭示隐藏的结构并检测扰动(例如基因敲除或化学处理)在数据中的影响原创 2024-11-08 12:31:59 · 817 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和Python及R聚类和亚群识别
在 MATLAB 中进行聚类和亚群识别可以使用一些内置函数和工具箱,如 **Statistics and Machine Learning Toolbox** 和 **Bioinformatics Toolbox**。以下是如何使用 MATLAB 进行聚类和亚群识别的详细步骤,尤其是用于检测和分析选择性扰动效应。原创 2024-11-08 10:37:11 · 1037 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和R及Python亚群差异表达分析
在进行亚群差异表达分析以检测和分析选择性扰动效应时,MATLAB 可以通过一系列步骤来实现这一目的。以下是如何使用 MATLAB 进行这样的分析的简要步骤和示例。原创 2024-11-08 10:33:29 · 692 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和R及Python病例对照分析
在MATLAB中,病例对照分析通常用于比较暴露组与非暴露组的结果,并计算风险比、优势比(Odds Ratio, OR)等统计量。以下是一个基于2x2列联表的病例对照分析步骤,包括OR计算、置信区间、卡方检验等内容。原创 2024-11-07 11:59:39 · 1239 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和Python多语高维转录分析
在 MATLAB 中进行高维转录分析(例如单细胞 RNA 测序 scRNA-seq 分析)可以使用以下步骤,包括数据导入、预处理、降维、聚类和差异表达分析。 MATLAB 的矩阵操作能力和工具箱(如统计和机器学习工具箱)提供了高效的分析手段。原创 2024-11-07 10:00:02 · 862 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和Python单细胞RNA测序
在MATLAB中处理单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据通常涉及数据读取、预处理、降维和聚类分析等步骤。MATLAB拥有生物信息学工具箱(Bioinformatics Toolbox)和其他数据处理工具箱,可以用于单细胞RNA测序分析。以下是一些基本的步骤和示例代码,帮助您使用MATLAB进行单细胞RNA测序分析。在Python中,单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据分析可以使用多种专门的工具和库,如Scanpy、Seurat (for R, interoperable with Python)原创 2024-11-06 12:20:00 · 1129 阅读 · 0 评论 -
Python病例细胞生物信号计算分析模型
1. 对照病例标签计算细胞干扰状态,对比真实数据分析生物信号。2. 使用外周血单核细胞 RNA 测序谱模拟干扰引起的细胞功能生物学变化。3. 使用降维方法预先处理标签预测模型的输入特征,并对比其他表征单细胞数据中的扰动效应的计算方法。4. 评估细胞的区分基因是否与已知的健康血浆和恶性肿瘤特征相匹配。原创 2024-11-05 12:32:28 · 1145 阅读 · 0 评论 -
Python热化学固态化学模型模拟
1. 使用热化学方式,从材料项目数据库获得热力学数据构建固态材料无机合成模拟模型。2. 固态反应网络是热力学相空间的模型,使得能够纳入简单的反应动力学行为。3. 反应坐标图可视为加权有向图,其表示出热力学相空间的密集连接模型。4. 使用模型预测尚未合成的新型电池材料的合成路线。原创 2024-10-31 22:04:14 · 903 阅读 · 0 评论 -
Python多语双峰分布
双峰分布 是一种概率分布,其概率密度函数有两个峰值。相比于常见的单峰分布(如正态分布),双峰分布意味着数据集中存在两个相对独立的子群体,每个子群体都围绕着一个不同的中心值聚集。原创 2024-10-28 21:49:53 · 771 阅读 · 0 评论 -
Python铅蓄放电热力学无量纲模拟分析
1. 非等压电池放电物理模型模拟高放电对流现象。2. 配置电池和简化化学性质分析,分析液体热力学化学过程及数学计算方式。3. 使用无量纲化系统确定系统中的主导效应,构建模型数值解析。4. 推导出模型系统的三个解析近似解,并在接近小极限的情况下进行渐近分析。原创 2024-10-21 20:33:59 · 934 阅读 · 0 评论 -
Python电化学生物医学(促甲状腺激素)分析
1. 使用电位动力学测量和阻抗谱分析,绘制阻抗谱的奈奎斯特图。2. 在阻抗谱图中找到半圆直径,或在电位动力学测量中找到峰值电位和峰值电流。3. 以促甲状腺激素的电化学免疫测定作为示例,绘制电子转移动力学曲线。4. 奈奎斯特图中直线段表示扩散受限过程,半圆直径表示电子转移电阻。原创 2024-10-20 21:36:11 · 871 阅读 · 0 评论 -
Python和MATLAB锂电铅蓄电化学微分模型和等效电路
1. 对比三种电化学颗粒模型:电化学的锂离子电池模型、单粒子模型和带电解质的单粒子模型。2. 求解粒子域内边界通量与局部电流密度有关的扩散方程。3. 扩展为两个相的负或正电极复合电极粒子模型。4. 模拟四种耦合机制下活性物质损失情况。5. 模拟锂离子电池三参数模型等效电路。原创 2024-10-19 20:13:27 · 781 阅读 · 0 评论 -
2024年Python最受欢迎桑基图
桑基图是一种数据可视化技术或流程图,强调从一种状态到另一种状态或从一个时间到另一个时间的流动/移动/变化,其中箭头的宽度与所描绘的广泛属性的流速成正比。桑基图强调系统内的主要转移或流动。它们有助于确定流动中最重要的贡献。它们通常显示定义的系统边界内的守恒量。原创 2024-10-18 12:00:25 · 583 阅读 · 0 评论 -
MATLAB和Python电车电池制造性能度量分析
1. 分析全电池制造端开路电压曲线,解析电化学指标或特征,了解电池的热力学和动力学特性。2. 测试相同活性材料(正极和石墨负极)的两批电池,列出模型提取的电化学特征并可视化分析结果。3. 使用类似电压拟合方法定量分析,缩小制造工艺差异。4. 性能分析出正极和负极容量、正极和负极锂化学计量以及可循环锂库存的容量。原创 2024-10-16 19:24:53 · 1048 阅读 · 0 评论 -
Python和CUDA(C++)量子退火和伊辛二次算法模型
1. 简化量子退火或离散优化算法处理,使用张量网络模拟和动态系统方法及神经网络逼近。2. 实现并行退火算法和CUDA支持下穷举搜索法。3. 使用大都会算法模拟二维自旋玻璃伊辛模型并测量磁化率、比热容和能量。4. 对比其他组合优化解方法,使用英伟达A100 GPU测试。原创 2024-10-14 19:30:00 · 1188 阅读 · 0 评论 -
Python和C++及MATLAB低温磁态机器学习模型
1. 使用小规模磁态训练模型,并在二维三维爱德华兹-安德森模型上使用四种算法测试:贪婪算法、模拟退火算法、并行回火算法和本模型。2. 将磁态基态搜索视为马尔可夫决策过程 (MDP),学习最优策略以累积其最大回报。3. 设计图神经网络式编码器表征状态和动作。4. 模型求解非确定性多项式时间问题。原创 2024-10-11 21:55:20 · 912 阅读 · 0 评论 -
Python和MATLAB自旋玻璃投资组合神经网络广义方程
1. 投资者根据多个目标和风险承受能力找到最佳分配权重,获得更高夏普比率。2. 模拟自旋玻璃模型,绘制模型测量热图以及量子近似优化算法3. 神经网络广义方程对免疫库分类学习原创 2024-10-10 22:44:29 · 1267 阅读 · 0 评论 -
Python微震波频散相速分析
1. 在二维均匀介质均匀源中合成互相关函数以便构建波层析成像。2. 闭环系统中微积分计算情景:完美弹性体震波、随机外力对模式的能量分配。3. 开环系统中微积分计算情景:无数震源激发波方程、闭合曲线上的随机源、不相关平面波事件。4. 整理地震波场频谱数据,选择局部平稳状态数据,对数据归一化去噪平滑。5. 通过频率-时间分析等方法了解频散曲线。原创 2024-10-10 11:50:46 · 961 阅读 · 0 评论 -
Python噪声敏感度和沉积区震动波
1. 遵循波传播物理原理,使用正逆向建模环境噪声,分析地震空间变化源谱的相关性。2. 使用格林函数预先计算地震波场。3. 模型可用于噪声源散射和衰减测量。4. 环境振动噪声可认为是地表各种牵引源传播的弹性波叠加,建立噪声源时间序列与格林函数的脉冲响应卷积5. 模拟沉积区震动波原创 2024-10-09 16:44:36 · 483 阅读 · 0 评论 -
Python和MATLAB及C++和Fortran胶体粒子数学材料学显微镜学微观流变学及光学计算
1. 二维成像拥挤胶体粒子检测算法2. 粒子的局部结构和动力学分析3. 椭圆粒子成链动态过程定量分析算法4. 小颗粒的光散射和吸收5. 活跃物质模拟群体行为6. 提取粒子轨迹粘弹性,计算剪切模量7. 计算悬浮液球形粒子多体流体动力学8. 概率规划全息图跟踪和表征粒子位置、大小和折射率原创 2024-10-08 16:19:18 · 1431 阅读 · 0 评论 -
Python和C++胶体粒子三维残差算法模型和细化亚像素算法
1. 使用信噪比、对比度噪声比和点扩展函数量化实验数据,增强共聚焦显微镜成像。2. 参考粒子跟踪算法:使用二维和三维径向模型细化亚像素。3. 胶体粒子三维图形分割学习模型模拟检测球形胶体。4. 使用网格搜索优化模型和归一化处理以避免光漂白。原创 2024-10-07 16:09:09 · 1200 阅读 · 0 评论 -
Python水循环标准化对比算法实现
1. 算法区分不同水循环数据类型:地下水、河水、降水、气温和其他,并使用相应标准化降水指数、标准化地下水指数、标准化河流水位指数和标准化降水蒸散指数。2. 绘制和计算特定的时间序列比较统计学相关性。3. 使用相关矩阵可视化集水区和显示空间信息。原创 2024-10-05 21:31:03 · 571 阅读 · 0 评论 -
Python和R及Julia妊娠相关疾病生物剖析算法
1. 算法使用了矢量投影、现代优化线性代数、空间分区技术和大数据编程2. 利用相应向量空间中标量积和欧几里得距离的紧密关系来计算3. 使用妊娠相关疾病(先兆子痫)、健康妊娠和癌症测试算法模型4. 使用相关性投影利用相关性和欧几里得距离之间的关系原创 2024-10-03 23:15:32 · 1466 阅读 · 5 评论 -
Python和C++及MATLAB和R时间序列中数学物理金融气象运动和电子材料
时间序列在数学物理学金融学和运动学和电子学以及材料学中的应用,使用Python和C++及MATLAB和Julia科学计算时序序列数据原创 2024-10-02 16:02:58 · 1070 阅读 · 0 评论 -
Python或R时偏移算法实现
1. 计算单变量或多变量时序距离,使用欧几里得、曼哈顿等函数量化不同时序差异。2. 量化生成时序之间接近度相似性矩阵。3. 使用高尔距离和堪培拉距离等相似度测量。4. 实现最小方差匹配算法,绘制步进模式的图形表示。5. 其他语言包算法实现原创 2024-10-01 20:18:27 · 1136 阅读 · 0 评论