转录组入门(pheatmap制作热图)

博客介绍利用R语言中的pheatmap包,基于tumorous_v_survive.txt数据制作转录组热图,该数据可接上一篇文章转录组分析的差异表达分析内容,最后得到相应结果图。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

1.数据类型,数据名称tumorous_v_survive.txt(可接上一篇文章转录组分析——差异表达分析
在这里插入图片描述
2.利用R语言中的pheatmap包进行热图的制作

#载入pheatmap
library(pheatmap)
# 进入到数据文件所在的文件夹路径下
setwd("E:/shengwuxinxi/基因组重测序数据操作步骤/作业")
#导入数据文件
mat=read.table("tumorous_v_survive.txt",header=TRUE,row.names=1,sep="\t",check.names = F)
dim(mat)
#利用pheatmap画热图,fontsize参数是用来设置字体大小
pheatmap(mat,cluster_rows =T,scale = "row",clustering_method = "average",fontsize=5,fontsize_row=5,fontsize_col=10,color=colorRampPalette(rev(c("red","white","blue")))(102))

3.得到的结果图是
在这里插入图片描述

评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值