转录组入门（pheatmap制作热图）

最新推荐文章于 2025-07-02 21:08:32 发布

xingyuan6

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CC 4.0 BY-SA版权

文章标签：转录组热图 R语言 pheatmap

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/jingshuanghuakai/article/details/93498887

博客介绍利用R语言中的pheatmap包，基于tumorous_v_survive.txt数据制作转录组热图，该数据可接上一篇文章转录组分析的差异表达分析内容，最后得到相应结果图。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

1.数据类型，数据名称tumorous_v_survive.txt（可接上一篇文章转录组分析——差异表达分析
在这里插入图片描述
2.利用R语言中的pheatmap包进行热图的制作

#载入pheatmap
library(pheatmap)
# 进入到数据文件所在的文件夹路径下
setwd("E:/shengwuxinxi/基因组重测序数据操作步骤/作业")
#导入数据文件
mat=read.table("tumorous_v_survive.txt",header=TRUE,row.names=1,sep="\t",check.names = F)
dim(mat)
#利用pheatmap画热图，fontsize参数是用来设置字体大小
pheatmap(mat,cluster_rows =T,scale = "row",clustering_method = "average",fontsize=5,fontsize_row=5,fontsize_col=10,color=colorRampPalette(rev(c("red","white","blue")))(102))

3.得到的结果图是
在这里插入图片描述