27、生物分子事件提取与双通道正交镜像滤波器组的多目标设计

生物分子事件提取与双通道正交镜像滤波器组的多目标设计

生物分子事件提取

特征定义

在生物分子事件提取中，定义了多种特征来辅助识别和分类事件：
1. 布尔值特征 ：利用依赖路径信息定义了两个布尔值特征。第一个特征检查当前标记的子节点是否为命题，且该子节点的组块包含蛋白质；第二个特征仅当当前标记的子节点是蛋白质且其依赖标签为 OBJ 时触发。
2. 最短路径 ：以当前标记到最近蛋白质的距离作为特征，这是一个整数值特征，其值等于当前标记与最近蛋白质之间的标记数量。
3. 单词前缀和后缀 ：固定长度（设为 n）的单词后缀和前缀有助于从文本中检测事件触发词。若对应单词长度小于等于 n - 1，或标记本身为标点符号、包含特殊符号或数字，则特征值未定义，用 ND 表示。在本研究中，考虑长度至多为四个字符的前缀和后缀。
4. 上下文中的命名实体 ：计算句子各种上下文中命名实体（NEs）的频率。假设当前标记为 w，句子长度（以单词数量计）为 L，定义不同的上下文大小为 context - size = L / K（K 取值 1 到 5），以 w 为中心定义上下文窗口为 context - window - size = 2 * context - size + 1。当窗口大小超过句子长度时，添加空槽并用“Other - than - NEs”（用 O 表示）填充。对于单词 w，定义一个长度为 5 的特征向量，根据 K 的值触发相应特征，特征值等于上下文窗口内 NEs 的数量。

数据集