8、基因多态性与肺癌风险研究方法解析

基因多态性与肺癌风险研究方法解析

1. 研究设计参数设定

在进行基因与疾病关联研究时，有几个关键参数需要确定。
- 临界参数P0 ：P0是由基因多态性定义的高风险群体的患病率决定的关键参数，其值取决于所研究的基因，范围在1%到50%之间。
- 优势比（OR） ：研究中要检测的优势比需设定在合理范围内，对于所研究的基因，OR值约为2.0比约为5.0更现实。而且，检测OR为2.0时所需的样本量比检测OR为5.0时大得多。
- 统计误差概率 ：通常设定显著性水平为5%（α = 0.05），检验效能为80%（β = 0.20）。若要测试多个基因，可通过将显著性水平α除以基因数量或主要假设的测试数量来进行多重比较调整。

以下是一个功率计算的示例：
假设对于某一给定基因，纯合变异基因型比野生型纯合子或野生型/变异杂合子具有更高的癌症风险。变异纯合子的患病率估计为P0 = 20%，且病例组和对照组的招募人数相同。为了在显著性水平α = 0.05、检验效能为80%的情况下检测到OR为2，总共需要n = 269名可评估患者，即n = 135例病例和n = 135例对照。若将OR放宽到3，则仅需要n = 50例病例和n = 50例对照。如果患病率高于20%，例如P0 = 40%，则样本量分别从269和100降至208和84。这些计算使用了PASS 2002的逻辑回归样本量程序。

OR值	患病率P0	所需病例数