初步分析CCLE和GDSC的数据——RNA表达矩阵

CCLE是Cancer Cell Line Encyclopedia的简称， 是与肿瘤有关的细胞系的百科全书项目。

GDSC是Genomics of Drug Sensitivity in Cancer的简称，其中也有细胞系的药物敏感性数据。

 

下载细胞系的相关信息文件

wget ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/project/cancerrxgene/releases/current_release/Cell_Lines_Details.xlsx

下载基因芯片的RMA数据(Robust Multi-array Average),

wget ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/project/cancerrxgene/releases/current_release/sanger1018_brainarray_ensemblgene_rma.txt.gz

细胞系的药物敏感性数据如下

wget ftp://ftp.sanger.ac.uk/pub/project/cancerrxgene/releases/current_release/v17.3_fitted_d