在SimpleITK形式下，将RAS和IJK坐标系互转

原创

于 2022-08-30 16:39:30 发布 · 819 阅读

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#python #开发语言

本文介绍如何使用Python的SimpleITK库在Slicer软件中实现从RAS坐标到像素坐标的转换方法。首先读取了nrrd格式的医学图像文件，并通过调整方向矩阵和原点坐标来适配Slicer的坐标系。接着定义了两个函数：一个用于将RAS坐标转换为IJK像素坐标，另一个则实现了逆向转换。

参考文章slicer软件中RAS转换为像素坐标方法

import SimpleITK as sitk    
import numpy as np            

itkimage=sitk.ReadImage("MRBrainTumor1.nrrd")

#先转成list,再由list转为numpy
numpyOrigin = np.array(list(itkimage.GetOrigin()

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